使用项目章签订的劳动合同，在认定劳动关系时可能会存在一定的争议，但并非绝对不能认定劳动关系，具体需结合实际情况判断。以下从几个方面进行分析：

1. 项目章的法律效力：

   • 项目章通常是公司为特定项目而刻制的印章，其使用范围一般限于该项目相关事务。与公司的公章或合同专用章相比，项目章在代表公司意志方面可能存在一定的局限性。
   • 如果项目章的使用得到了公司的明确授权，且在使用过程中公司未提出异议，那么项目章签订的劳动合同在形式上可能被视为有效。但若公司未授权或事后否认，则可能引发争议。

2. 劳动合同的签订主体：

   • 劳动合同的签订主体应为用人单位和劳动者。如果项目章能够代表用人单位（即公司）的意志，且劳动者在签订合同时对此无异议，那么劳动合同的签订主体在形式上可能是合法的。
   • 但若项目章无法代表公司意志，或劳动者在签订合同时对项目章的效力存在疑问，则可能影响劳动关系的认定。

3. 实际履行情况：

   • 劳动关系的认定不仅取决于劳动合同的签订形式，还取决于双方的实际履行情况。如果双方在实际工作中按照劳动合同的约定履行了各自的义务，如劳动者提供了劳动、用人单位支付了工资等，那么即使劳动合同是用项目章签订的，也可能被认定为存在劳动关系。
   • 反之，如果双方未按照劳动合同的约定履行义务，或存在其他争议点，则可能影响劳动关系的认定。

4. 法律后果与建议：

   • 如果因项目章签订的劳动合同引发争议，双方可能需要通过劳动仲裁或诉讼等方式解决。在仲裁或诉讼过程中，法院或仲裁机构会综合考虑上述因素，以及双方提供的证据材料，来认定是否存在劳动关系。
   • 为避免此类争议，建议用人单位在签订劳动合同时使用公章或合同专用章，并明确授权代表签字。同时，劳动者在签订合同时也应仔细审查合同内容，确保合同条款合法合规，并保留好相关证据材料。

在实际操作中，如果因项目章签订的劳动合同引发了劳动关系认定方面的争议，建议双方及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。