新公司法下，股东会决议的通过比例主要依据决议事项的性质而定，具体分为一般事项和特殊事项（重大决策）两种情况。以下是对这一问题的详细解答：
一、一般事项决议的通过比例
有限责任公司：
- 法律依据：根据《中华人民共和国公司法》第四十三条第一款的规定，股东会会议作出修改公司章程、增加或者减少注册资本的决议，以及公司合并、分立、解散或者变更公司形式的决议，必须经代表三分之二以上表决权的股东通过。但此处我们讨论的是一般事项，对于一般的决议事项，如公司经营范围变更、董事监事选举等，若公司章程没有特别规定，则通常需代表二分之一以上表决权的股东通过。不过，更准确且全面的理解是，除非公司章程另有规定，否则一般事项的决议应经代表过半数表决权的股东通过（这里的“过半数”不包含本数，即需超过50%）。但实践中，许多公司章程会规定一般事项也需更高比例，如三分之二，以增强决策的稳定性，因此具体需查阅公司章程。
- 实际操作：在实际操作中，有限责任公司应首先查阅公司章程，以确定一般事项决议的具体通过比例。若公司章程未作特别规定，则可参照《公司法》的默认规则，即过半数表决权通过。
股份有限公司：
- 比例要求：对于非特别事项的决议，股份有限公司需出席会议的股东所持表决权的过半数通过。这里的“过半数”同样不包含本数。
- 实际操作：股份有限公司在召开股东大会时，应确保会议通知、召集、主持等程序符合《公司法》及公司章程的规定，并准确计算出席会议的股东所持表决权比例，以确保决议的合法性和有效性。
二、特殊事项（重大决策）决议的通过比例
有限责任公司与股份有限公司：
- 法律依据：根据《中华人民共和国公司法》第四十三条第二款的规定，涉及修改公司章程、增加或减少注册资本、合并、分立、解散或改变公司形式等重大事项时，需代表三分之二以上表决权的股东通过。此处的“三分之二以上”包含三分之二本身，且强调的是表决权而非股东人数。
- 实际操作：在处理这些重大事项时，公司应特别谨慎，确保股东会的召集、通知、表决等程序严格符合《公司法》及公司章程的规定。同时，应准确计算代表三分之二以上表决权的股东是否同意决议，以避免因程序瑕疵或表决权计算错误而导致决议无效或被撤销。
上市公司特殊规定：
- 法律依据：对于上市公司而言，除了遵守《公司法》的一般规定外，还需遵守《上市公司重大资产重组管理办法》等相关规定。例如，上市公司股东大会就重大资产重组等特定事项作出决议，必须经出席会议的股东所持表决权的三分之二以上通过。关联股东应当回避表决，以确保决议的公正性。
- 实际操作：上市公司在处理重大资产重组等特定事项时，应特别注意关联股东的回避表决问题，以及决议的公告和披露义务。同时，应确保决议的通过比例符合相关法律法规及监管要求，以避免潜在的法律风险和监管处罚。
三、其他注意事项
- 程序合规性：股东会的召集程序、表决方式等还需严格符合公司章程及《公司法》的相关规定。例如，股东会会议应提前通知全体股东（有限责任公司通常提前十五日，股份有限公司通常提前二十日），并确保会议记录的完整性和准确性。
- 表决权计算：在计算表决权时，应排除无表决权的股份（如未出资或出资存在瑕疵的股份），以确保表决权的准确计算。同时，对于存在股权质押、冻结等情形的股份，也应根据相关规定和协议确定其表决权是否受限。
- 专业咨询：鉴于公司类型和决议事项的多样性，以及可能存在的特殊规定和监管要求，建议在做出任何决策前，仔细查阅公司章程及相关法律法规，并咨询专业律师（即我本人，李再庆律师，专注于建设工程、公司事务领域），以确保决策的合法性和有效性，避免潜在的法律风险。
总结来说，新公司法下股东会决议的通过比例主要依据决议事项的性质而定。对于一般事项，有限责任公司通常需过半数表决权通过（具体需查阅公司章程），股份有限公司需出席会议的股东所持表决权的过半数通过；对于特殊事项（重大决策），则需代表三分之二以上表决权的股东通过。同时，公司还需注意程序合规性、表决权计算等问题，并在必要时咨询专业律师。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。