结论前置：女方奶奶有案底并不绝对禁止女方与现役军人进行军婚登记，但具体是否影响，需根据奶奶案底的性质、严重程度以及军队的政治审查要求来综合判断。

法律规定层面

根据《中华人民共和国民法典》及相关军婚管理规定，法律并未明确禁止有案底的人的亲属（如奶奶）与现役军人结婚。军婚的登记主要关注的是拟结婚双方本人的政治背景、社会关系及个人品行，而非其亲属的过往记录。因此，从直接法律规定来看，女方奶奶有案底不构成女方与现役军人军婚登记的绝对障碍。

实际审查可能受限情况

尽管法律没有直接禁止，但军队在现役军人婚恋审查方面有着严格的程序和要求，其中政治审查是重要环节。在审查过程中，军队会综合考虑拟结婚对象及其家庭成员的政治背景、社会关系等因素，以确保军队的纯洁性和安全性。

1. 轻微违法记录：若女方奶奶的案底属于轻微违法行为，如情节较轻的治安处罚记录，且已改过自新，未对个人品德、社会表现造成持续性不良影响，那么在其他条件符合要求的情况下，一般不影响女方与现役军人结婚。

2. 严重违法犯罪记录：若女方奶奶的案底涉及严重刑事犯罪，如危害国家安全、严重暴力犯罪等，此类情况可能被认为不符合军队对军人配偶家庭背景“政治可靠、思想进步、品行端正”的隐性要求。虽然直接的法律障碍不存在，但可能会在政治审查环节遇到更为严格的评估，进而增加军婚登记的难度。

综合考量与个案差异

军队在政治审查时会综合考虑女方奶奶的案底性质、严重程度以及与军人的关系等因素。每个具体案件都有其独特性，审批结果也会因具体情况而异。例如，如果军人从事的是涉及军事机密的高科技工作，那么非军人一方（包括其家庭成员）若有危害国家利益的犯罪记录，就可能成为双方结婚的障碍。因为这种情况下，非军人一方的行为可能会对军人的工作安全构成潜在威胁。

建议与指导

• 在申请军婚时，女方应如实报告家庭成员的犯罪记录情况，以便军队进行准确的政治审查。
• 鉴于每个案件的独特性，如果女方奶奶有案底且担心影响军婚登记，建议直接向我咨询，我可以根据女方的具体情况和军队的相关政策，为提供更具体的建议和解决方案。

综上所述，女方奶奶有案底对军婚登记的影响并非绝对，而是需要根据案底的性质、严重程度以及军队的政治审查要求来综合判断。因此，在处理此类问题时，应秉持客观、全面的态度，并寻求专业法律意见以确保合法合规。