关于保荐协议是否需要保荐机构法定代表人亲笔签字的问题，这主要涉及到保荐机构在保荐项目中的签字责任和内部控制要求。

首先，根据《证券发行上市保荐业务管理办法》以及相关监管要求，保荐机构在从事首次公开发行股票并上市（首发）和上市公司再融资保荐业务时，需要建立健全保荐业务的内部控制制度，并强化保荐机构管理层对保荐项目质量控制的签字督导责任。这一要求旨在确保保荐机构在保荐过程中能够勤勉尽责，严格控制风险，提高保荐业务整体质量。

具体到签字责任方面，保荐机构在推荐首发和再融资项目时，需要履行公司内部决策程序。在这个过程中，保荐机构的董事长、总经理（或类似职责人员）需要在保荐项目首次申报文件，包括招股说明书（募集说明书）、发行保荐书、保荐工作报告（保荐机构尽职调查报告）等文件中签字确认。这一签字行为不仅是对保荐项目质量的认可，也是承担相应法律责任的一种表现。

此外，在反馈意见回复报告、举报信核查报告和发审委意见回复报告等文件中，保荐机构的董事长或总经理也需要出具声明并签字确认，以进一步强化其对保荐项目质量的控制责任。

因此，在保荐协议及相关申报文件中，确实需要保荐机构的法定代表人（或类似职责人员，如董事长、总经理）亲笔签字，以履行其作为保荐机构管理层的签字督导责任，并确保保荐项目的质量和合规性。这一要求有助于保护投资者特别是中小投资者的合法权益，促进证券市场的健康发展。