承包诊所科室一般是违法的，这种行为违反了《医疗机构管理条例》及相关法律法规。以下从多个角度进行详细分析：
一、法律法规的明确规定
《医疗机构管理条例》：
- 该条例明确规定，医疗机构执业必须遵守有关法律、法规和医疗技术规范，以救死扶伤、防病治病、为公民的健康服务为宗旨。医院将科室承包出去的行为，违背了医疗机构应依法依规执业的要求，扰乱了正常的医疗管理秩序。
- 条例中还规定，出卖、转让、出借《医疗机构执业许可证》的，将面临严厉处罚。虽然科室承包不完全等同于这些行为，但在实际执法中，可参照相关条款进行处罚。
《关于城镇医疗机构分类管理的实施意见》：
- 该意见严禁任何形式的“科室承包”“科室出租”等行为，旨在规范医疗机构的运营模式，保证医疗服务的质量和安全，维护患者的合法权益。
《卫生部关于对非法采供血液和单采血浆、非法行医专项整治工作中有关法律适用问题的批复》：
- 根据此批复，医疗机构若将科室或房屋承包、出租给非本医疗机构人员或其他机构，并以本机构名义开展诊疗活动，将按照《医疗机构管理条例》的相关规定予以处罚。这种行为被视为变相的非法行医，因为承包科室的主体可能不具备相应的医疗资质和能力。
二、违法承包科室的法律后果
对医院的处罚：
- 医院若违反相关规定，将可能面临没收非法所得、罚款甚至吊销《医疗机构执业许可证》的处罚。虽然科室承包不完全等同于出卖、转让、出借许可证，但执法部门在实际操作中可能会参照相关法规进行处罚。
赔偿患者损失：
- 如果承包科室在诊疗过程中给患者造成损害，医院作为责任主体，需要承担相应的赔偿责任。患者是基于对医院的信任而接受诊疗服务，医院有义务对其内部的医疗行为负责。
三、合法医疗合作模式与科室承包的区别
- 需要注意的是，存在一些合法的医疗合作模式，如医院之间的技术协作、学科共建等。这些合作通常是在双方具备相应资质和条件的基础上，按照合法合规的程序进行，以提升医疗服务水平和质量为目的。
- 合法的医疗合作模式与科室承包有本质区别。前者遵循法律法规，通过合法合规的程序进行，旨在提升医疗服务质量；后者则违法违规，可能扰乱医疗秩序，损害患者利益。
四、实际案例与风险警示
- 在实际执法中，已经有多起因科室承包而被处罚的案例。这些案例表明，科室承包不仅可能面临法律处罚，还可能对医院的声誉和患者的信任造成严重影响。
- 医疗机构应自觉遵守法律法规，规范自身行为，避免涉及科室承包等违法行为。同时，广大患者在选择医疗机构时，也应仔细甄别，选择正规、合法的医疗机构，以保障自己的健康权益。
总结与建议：
承包诊所科室是违法的，这种行为不仅违反了相关法律法规，还可能对医院的声誉和患者的信任造成严重影响。医疗机构应自觉遵守法律法规，规范自身行为，提供高质量、安全的医疗服务。如果您在医疗领域遇到任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我将为您提供专业的法律意见和帮助。