结论：车贷还款金额已超过贷款本金时，是否可以协商后期不还，需视具体情况而定，但通常情况下，不能仅因还款总额超过本金就单方面决定后期不还。以下从多个角度进行分析：

一、合同条款的约束

1. 合同约定：车贷合同是双方自愿签订的法律文件，其中明确规定了贷款金额、利率、还款期限、还款方式等关键条款。若合同中未约定在还款总额超过本金时可以提前终止还款或调整还款计划，那么借款人需继续按照合同约定履行还款义务。

2. 违约责任：若借款人单方面决定后期不还，将构成违约行为。根据合同约定，贷款方有权要求借款人承担违约责任，包括但不限于支付违约金、罚息，甚至可能通过法律途径追讨剩余贷款本金及利息。

二、法律规定的考量

1. 等价有偿原则：在民事法律关系中，等价有偿是一项基本原则。借款人获得贷款时，需承担还款义务，包括本金和利息。即使还款总额超过了本金，也是基于双方约定的利率和还款期限计算得出的，借款人仍需履行还款责任。

2. 消费者权益保护：虽然消费者在金融交易中享有一定的权益保护，但这并不意味着可以随意违反合同约定。若借款人认为贷款合同存在不公平、不合理之处，可通过合法途径寻求救济，如与贷款方协商修改合同条款、向监管部门投诉或提起诉讼等，而非单方面决定后期不还。

三、协商的可能性与策略

1. 协商基础：尽管不能单方面决定后期不还，但借款人仍可与贷款方进行协商，寻求更合理的还款方案。协商的基础是双方都有意愿解决问题，并愿意在合理范围内做出让步。

2. 协商策略：

   • 提供财务状况证明：借款人可向贷款方提供自己的财务状况证明，如收入证明、资产证明等，以说明自己当前的经济困难，并请求贷款方给予一定的宽限期或调整还款计划。
   • 提出合理还款方案：借款人可根据自己的实际情况，提出一个合理的还款方案，如延长还款期限、降低每月还款额等，以减轻自己的还款压力。
   • 寻求第三方协助：若双方协商无果，借款人可寻求第三方协助，如消费者协会、金融调解机构等，以促成双方达成和解。

四、法律后果的警示

1. 信用记录受损：若借款人单方面决定后期不还，将导致其信用记录受损。信用记录是个人金融活动的重要参考，一旦受损，将影响借款人未来的贷款申请、信用卡办理等金融活动。

2. 法律追讨：贷款方有权通过法律途径追讨剩余贷款本金及利息。若借款人拒不履行还款义务，贷款方可向法院提起诉讼，要求借款人承担法律责任。

建议：若您面临车贷还款金额已超过贷款本金的情况，建议您首先仔细审查贷款合同条款，了解自己的权利和义务；其次，与贷款方进行积极沟通，寻求合理的还款方案；最后，若协商无果或遇到法律纠纷，请及时向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。