结论前置：工资6000元但养老基数低于6000元，这种做法通常是不合法的。用人单位应当按照国家规定的职工实际工资总额的比例缴纳社会保险费，包括养老保险费，未按规定缴纳将损害员工的合法权益，并可能面临法律处罚。

法律背景与依据

1. 社保缴费基数的法律规定：

   • 根据《中华人民共和国社会保险法》及相关规定，用人单位应当按照国家规定的本单位职工工资总额的比例缴纳社会保险费，这包括养老保险费。这意味着社保缴费基数，特别是养老保险的缴费基数，应与职工的实际工资相符。
   • 《关于规范社会保险缴费基数有关问题的通知》也明确指出，参保单位缴纳基本养老保险费的基数可以为职工工资总额，或为本单位职工个人缴费工资基数之和，且应在全省区市范围内统一核定办法。通常，职工本人以上一年度本人月平均工资为个人缴费工资基数。

2. 具体法律条款：

   • 《社会保险法》第六十条规定：“用人单位应当自行申报、按时足额缴纳社会保险费，非因不可抗力等法定事由不得缓缴、减免。职工应当缴纳的社会保险费由用人单位代扣代缴，用人单位应当按月将缴纳社会保险费的明细情况告知本人。”
   • 若用人单位未按照职工实际工资缴纳社会保险费，包括养老保险费，则违反了上述法律规定。

可能的法律后果

1. 对员工的影响：

   • 用人单位少报、瞒报缴费基数，会导致职工社保权益受损。例如，养老金待遇、医保报销额度等可能会因为缴费基数低而降低，影响员工的长期福利。

2. 对用人单位的处罚：

   • 这种行为也违反了《社会保险法》等相关法律法规。一旦被社会保险行政部门查处，用人单位可能会面临责令限期改正、加收滞纳金甚至罚款等处罚。

员工应对措施

面对用人单位未按实际工资缴纳养老保险费的情况，员工可以采取以下措施维护自己的权益：

1. 沟通协商：

   • 首先尝试与用人单位的人力资源部门或相关负责人进行沟通，说明情况并要求按照实际工资调整养老保险缴费基数。

2. 举报投诉：

   • 如果协商无果，可以向所在地的社会保险经办机构或劳动监察部门举报投诉。这些机构会介入调查并督促用人单位改正违法行为。

3. 法律途径：

   • 在必要时，员工还可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼。通过法律手段来维护自己的合法权益是有效且正当的。

特殊情况说明

虽然通常情况下，养老保险缴费基数应与职工实际工资相符，但也存在一些特殊情况。例如，如果职工的工资低于当地社保缴费基数的下限，那么用人单位应按照下限来缴纳养老保险费。然而，这并不适用于本题中工资6000元但养老基数低于6000元的情况，因为6000元通常高于大多数地区的社保缴费基数下限。

综上所述，工资6000元但养老基数低于6000元，这种做法通常是不合法的。用人单位应遵守相关法律法规，确保员工的社保权益得到保障。如果员工遇到这种情况，可以采取上述措施来维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。