在诉讼过程中，如果被告公司申请破产，这是一个涉及法律程序和权益保障的重要问题。以下是对此问题的详细解答：

一、法律原则与程序中止

根据《中华人民共和国企业破产法》的相关规定，一旦法院受理了被告公司的破产申请，所有涉及该被告公司且尚未审结的民事诉讼或仲裁程序都将被中止。这一措施旨在确保破产程序的顺利进行，避免在财产处置上产生冲突。因此，如果您的诉讼正处于进行中，且被告公司申请了破产，那么您的诉讼将会暂时中止。

二、具体处理方式

1. 被告为法人企业的情况

   • 给付之诉：

     • 如果诉讼中只有被告公司一个被告，且没有无独立请求权的第三人，那么诉讼将中止，您需要向破产管理人申报债权。一旦企业被宣告破产，诉讼将终结，您的债权将按照破产程序进行清偿。
     • 如果诉讼中还有其他被告或无独立请求权的第三人，诉讼同样会中止。您需要申报债权，并在破产程序终结后，恢复审理，根据判决向其他被告或第三人主张权利。

   • 确认之诉：这类诉讼通常不受破产申请的影响。确认之诉旨在确定法律关系或权利的存在与否，对破产程序中债权性质和范围的确定具有重要意义。因此，在管理人接管财产后，这类诉讼将继续进行。

2. 被告为非法人组织或自然人的情况

   • 非法人组织：如果被告是非法人组织，如合伙企业等，将参照适用企业法人破产的相关规定来处理诉讼。
   • 自然人（试点地区）：在部分试点地区，如果自然人适用破产方案，那么未结诉讼的处理将依据当地试点规定进行，通常也会涉及中止、待财产管理方案确定后继续等程序安排。

三、债权申报与清偿

• 债权申报：在破产程序中，您需要按照法定程序向破产管理人申报债权，包括在诉讼中涉及的债权。管理人将对您的债权进行审核和确认。
• 债权清偿：破产程序结束后，如果您的债权得到确认且破产财产足以清偿，您将通过破产分配程序获得相应清偿。如果破产财产不足，您的债权可能只能按比例部分清偿或无法得到清偿。

四、注意事项与建议

• 地区差异：由于具体处理方式可能因地区和相关法律法规的不同而有所差异，建议您及时咨询专业律师或法律机构以获取准确的法律意见和帮助。
• 诉讼策略调整：面对被告破产的情况，您应密切关注破产程序的进展，并根据实际情况及时调整诉讼策略，以确保自身权益得到有效保护。

综上所述，如果在诉讼过程中被告公司申请破产，您的诉讼将会依法中止。您需要向破产管理人申报债权，并根据破产程序获得相应清偿。同时，请关注地区差异和诉讼策略的调整，以确保您的合法权益得到充分保障。