违停时人在车上且开着双闪，是否会被罚款取决于具体情况。以下从不同角度为您详细分析：
一般情况与及时驶离
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十三条，对于违反机动车停放、临时停车规定的，交警可以指出违法行为，并予以口头警告，令其立即驶离。若您在现场且经交警指出后立即驶离，未妨碍其他车辆、行人通行，则一般不会被罚款。这体现了执法中的教育与处罚相结合原则。
造成交通妨碍的情况
- 禁止停车区域：无论人是否在车上，只要停车行为违反了相关规定，且妨碍了其他车辆、行人通行，驾驶人拒绝驶离的，交警可对其处以二十元以上二百元以下罚款，并可将车辆拖移至不妨碍交通的地点或公安机关交通管理部门指定的地点停放。因此，即使您开着双闪，在禁止停车区域违停且拒绝驶离，仍可能面临罚款。
- 未按规定停放：若车辆虽在可停区域但未按规定停放（如未紧靠道路右侧），交警通常会先给予口头警告，并要求驾驶人立即驶离。若您拒绝配合或无法及时驶离，且其行为影响了交通秩序，同样可能面临罚款处罚。
电子眼抓拍与地区差异
- 电子眼抓拍：在设有电子眼的禁停区域，即使人在车上且开着双闪，若停车超过规定时间（如某些地区设定的抓拍违停时间阈值为五分钟），也会被判定为违章停车并可能受到罚款处罚。因此，您在停车时应特别注意观察周边是否有电子眼设备，并遵守相关停车规定。
- 地区差异：不同地区对于违停的处理方式可能存在差异。一些城市管理较为严格，一旦发现违停行为，不论人是否在车上，都可能直接进行罚款处罚。而在交通压力相对较小的地区，执法力度可能相对宽松，但仍需警惕在特定时段或重点区域的加强执法。
建议与总结：
- 为避免因违停被罚款，您在停车前应仔细观察周边交通标志和标线，确保车辆停放在允许的区域内，并尽快完成所需事务后及时驶离。
- 若因紧急情况需要临时停车，应开启双闪灯以警示其他车辆，并确保自身安全。同时，也应注意观察停车地点的交通标志和规定，避免违规停车带来的不必要的罚款和扣分。
- 若您对违停处罚有异议或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。