结论前置：公务员持有股份但不参与企业经营是否违法及如何处理，需分情况讨论，具体如下：

1. 若公务员身份与持股企业存在利益关联，则可能违法
   根据《中华人民共和国公务员法》第五十九条，公务员不得“违反有关规定从事或者参与营利性活动，在企业或者其他营利性组织中兼任职务”。即使公务员不参与企业经营，若其身份与持股企业存在利益关联（如企业经营范围与其职务管辖的业务范围重合），仍可能构成“违规从事营利活动”，违反廉洁纪律。
   处理方式：
   

• 公务员应主动向组织报告持股情况，并申请退出股份或调整职务，避免利益冲突；
  
• 若未主动报告且被查处，可能面临警告、记过、降级等纪律处分，情节严重者可能被开除公职；
  
• 若持股行为涉及贪污、受贿等犯罪，还将依法追究刑事责任。

1. 若公务员持股企业与其职务无利益关联，且符合例外情形，则可能不违法
   根据《公务员法》及相关规定，公务员可以持有非上市公司股份，但需满足以下条件：
   

• 持股企业与公务员职务无利益关联（如企业经营范围与公务员职务管辖范围无关）；
  
• 持股行为未利用职务便利谋取私利；
  
• 符合地方或部门的具体限制性规定（如部分地区禁止公务员持有任何企业股份）。
  处理方式：
  
• 公务员需向组织申报持股情况，并确保持股行为符合上述条件；
  
• 若组织认定持股行为合规，则无需处理；
  
• 若组织认定存在利益关联或违规，公务员应按要求退出股份或调整职务。

1. 若公务员通过亲属间接持股企业，仍可能构成违规
   根据《中国共产党纪律处分条例》第九十四条，公务员不得“纵容、默许配偶、子女及其配偶等亲属、身边工作人员和其他特定关系人利用本人职务上的影响谋取私利”。若公务员通过亲属间接持股企业，且企业与其职务存在利益关联，仍可能被认定为违规。
   处理方式：
   

• 公务员应主动向组织报告间接持股情况，并采取措施消除利益关联（如退出股份或调整职务）；
  
• 若未主动报告且被查处，将面临纪律处分，情节严重者可能被开除公职。

建议：
公务员持股问题涉及廉洁纪律和职务合规性，建议谨慎处理。若您或您身边的人遇到此类问题，可直接向我咨询，我将结合具体情形提供详细法律分析。