商事仲裁申请执行的期限为二年，这一规定主要依据《中华人民共和国民事诉讼法》第二百五十条。以下是对商事仲裁申请执行期限的详细解释：
一、申请执行期限的具体计算
法律文书规定履行期间的情况：
- 从法律文书（如仲裁裁决书）规定履行期间的最后一日起计算。例如，如果仲裁裁决要求被申请人在收到裁决书后30日内支付款项，那么申请执行期限就从第30日的次日开始计算，即从第31日起算，至两年后的同一日期止。
法律文书规定分期履行的情况：
- 从规定的每次履行期间的最后一日起计算。如果仲裁裁决要求被申请人分三期支付款项，每期支付时间为收到裁决书后的第10日、第20日和第30日，那么每期的申请执行期限就分别从第10日、第20日和第30日的次日开始计算，即分别从第11日、第21日和第31日起算，至两年后的对应日期止。
法律文书未规定履行期间的情况：
- 从法律文书生效之日起计算。对于商事仲裁裁决，通常自作出之日起即发生法律效力，因此申请执行期限从裁决书作出之日的次日起计算，即从作出裁决书的第二日起算，至两年后的同一日期止。
二、申请执行期限的中止与中断
在申请执行期限内，如果出现法定情形，申请执行期限可以中止或中断：
中止情形：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，在申请执行时效期间的最后六个月内，因不可抗力或者其他障碍不能行使请求权的，申请执行时效中止。从中止时效的原因消除之日起，申请执行时效期间继续计算。例如，如果因自然灾害导致当事人无法行使请求权，且该自然灾害发生在申请执行时效期间的最后六个月内，那么申请执行时效将中止，直至自然灾害消除后继续计算。
中断情形：
- 申请执行时效因申请执行、当事人双方达成和解协议、当事人一方提出履行要求或者同意履行义务而中断。从中断时起，申请执行时效期间重新计算。例如，如果当事人在申请执行期限内达成了和解协议，那么申请执行时效将从达成和解协议之日起重新计算两年。
三、超过申请执行期限的法律后果
如果申请人未在法定期限内提出执行申请，且不存在中止、中断的情形，被执行人可以提出抗辩，法院可能裁定不予执行。但需要注意的是，被执行人未提出抗辩的，法院不会主动适用时效规定进行审查。因此，申请人应密切关注申请执行期限，确保在法定期限内提出执行申请。
四、实际操作建议
在实际操作中，建议申请人：
- 及时关注申请执行期限：确保在法定期限内提出执行申请，避免因超过期限而丧失执行权利。
- 保留相关证据：在申请执行过程中，保留好与案件相关的所有证据材料，以便在需要时提供证明。
- 咨询专业律师：如有任何疑问或困难，应及时向我咨询，以获取专业的法律帮助和指导。
综上所述，商事仲裁申请执行的期限为二年，申请人应密切关注这一期限，并在法定期限内提出执行申请。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。