公司偷税行为在5年后被发现，税务机关仍可依法进行处罚，处罚措施主要包括追缴税款、加收滞纳金以及罚款，具体处罚力度需根据偷税情节的严重程度来确定。以下从不同角度详细分析：
根据《中华人民共和国税收征收管理法》第五十二条的规定，因纳税人、扣缴义务人计算错误等失误，未缴或者少缴税款的，税务机关在三年内可以追征税款、滞纳金；有特殊情况的，追征期可以延长到五年。然而，对于偷税行为，该法条明确指出，税务机关追征其未缴或者少缴的税款、滞纳金，不受前款规定期限的限制。这意味着，即使偷税行为已经过去5年，税务机关仍有权追缴公司未缴或少缴的税款，并加收滞纳金。
对于偷税行为，税务机关除了追缴税款和滞纳金外，还会根据情节的严重程度处以罚款。根据《中华人民共和国税收征收管理法》第六十三条的规定，纳税人伪造、变造、隐匿、擅自销毁帐簿、记帐凭证，或者在帐簿上多列支出或者不列、少列收入，或者经税务机关通知申报而拒不申报或者进行虚假的纳税申报，不缴或者少缴应纳税款的，是偷税。对纳税人偷税的，由税务机关追缴其不缴或者少缴的税款、滞纳金，并处不缴或者少缴的税款百分之五十以上五倍以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
如果公司的偷税行为情节严重，构成犯罪的，还将依法追究刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》第二百零一条的规定，纳税人采取欺骗、隐瞒手段进行虚假纳税申报或者不申报，逃避缴纳税款数额较大并且占应纳税额百分之十以上的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大并且占应纳税额百分之三十以上的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
在实际操作中，税务机关会根据公司的偷税情节、数额大小、是否主动纠正等因素来综合判断处罚力度。因此，如果公司被发现存在偷税行为，建议尽快主动与税务机关沟通，积极配合调查，并主动补缴税款和滞纳金，以争取从轻或减轻处罚。
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