结论：一个200万元的贷款合同，如果没有纸质合同，并不直接等同于该合同存在瑕疵，但可能因缺乏书面形式而在证据效力、合同内容明确性等方面存在潜在风险。以下从多个角度进行分析：
一、合同形式与效力
合同形式要求：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同的形式并非仅限于书面形式，口头形式或其他形式在特定情况下也是有效的。然而，对于贷款合同这类涉及较大金额和复杂权利义务关系的合同，通常建议采用书面形式以明确双方的权利和义务。
书面合同的优势：
- 书面合同能够清晰地记录合同双方的具体约定，包括贷款金额、利率、还款期限、违约责任等关键条款，有助于减少争议和纠纷。
- 在发生纠纷时，书面合同作为直接证据，其证明力通常强于口头约定或其他形式的证据。
二、无纸质合同的风险
证据效力风险：
- 如果没有纸质合同，一旦发生纠纷，双方可能难以就合同内容达成一致，导致证据效力降低。此时，可能需要依赖其他证据（如电子邮件、短信、录音等）来证明合同的存在和内容，但这些证据的证明力可能较弱。
合同内容明确性风险：
- 纸质合同能够确保合同内容的明确性和完整性，避免因记忆模糊或理解差异而产生的争议。无纸质合同的情况下，合同内容可能因双方记忆或理解的不同而存在歧义。
三、应对措施与建议
补充书面合同：
- 如果可能的话，建议双方尽快补充签订书面贷款合同，以明确双方的权利和义务，降低潜在风险。
保留其他证据：
- 在无法补充书面合同的情况下，双方应尽可能保留与贷款相关的其他证据，如转账记录、聊天记录、电子邮件等，以证明合同的存在和内容。
咨询专业律师：
- 如果双方对合同内容或形式存在争议，建议咨询专业律师以获取法律意见和帮助。律师可以根据具体情况分析合同的效力、风险及应对措施，为双方提供专业的法律建议。
进一步思考：在实际操作中，贷款合同通常涉及较大的金额和复杂的权利义务关系，因此采用书面形式更为稳妥。如果确实没有纸质合同，双方应尽可能通过其他方式明确合同内容，并保留相关证据以降低潜在风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。