土地使用权在特定情形下可以单独判决份额，具体分析如下：

1. 按份共有的土地使用权
   若土地使用权由多个主体按份共有（如合作开发、联营、继承等情形），各共有人对共有土地使用权享有明确的份额比例。此时，若发生权属争议或分割纠纷，法院可根据《民法典》第三百零四条、第三百零九条等规定，结合共有人的约定或出资比例、贡献大小等因素，直接判决确认各共有人对土地使用权的份额比例。例如，甲、乙按3:7比例共有某地块使用权，法院可判决甲享有30%份额，乙享有70%份额。

2. 共同共有的土地使用权
   若土地使用权为共同共有（如夫妻共同财产、家庭共有财产），在共有基础丧失（如离婚、分家析产）时，需先分割为按份共有，再明确份额。此时法院可能分两步判决：

   • 第一步：判决解除共同共有关系，将土地使用权变更为按份共有；
     
   • 第二步：根据实际情况（如双方协商、评估价值、贡献等）判决具体份额。
     例如：夫妻离婚时，法院可能先判决原共同共有的土地使用权转为按份共有，再判决一方享有60%份额，另一方享有40%份额。

3. 特殊情形下的份额判决限制

   • 土地用途限制：若土地使用权涉及公益、公共设施或需整体利用（如学校、医院、道路用地），法院可能以“不宜分割”为由，判决维持共有状态或采取折价补偿、拍卖变价分割等方式，而非直接划分份额。
     
   • 登记制度限制：根据《不动产登记暂行条例》，土地使用权份额需通过登记明确。若判决份额与登记内容冲突，需同步办理变更登记，否则可能影响权利效力。

实务建议：
若涉及土地使用权份额争议，建议提前收集以下证据：

• 共有协议（如合作开发合同、联营协议）；
  
• 出资证明、贡献证明（如资金投入、土地改良记录）；
  
• 土地使用权登记证书（明确共有性质及登记份额）；
  
• 第三方评估报告（用于确定土地价值及分割比例）。
  

如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合证据和法律条款为您详细分析。