协议签字按手印拍照，在大多数情况下是有效的，但具体有效性还需结合多种因素综合判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、签字与按手印的法律效力
签字：签字是确认合同效力的关键要素之一。根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。签字作为个人专属的身份标识，具有明确的法律效力，能够证明当事人对协议内容的认可和接受。
按手印：按手印在法律上同样具有确认合同效力的作用。它作为一种身份确认的方式，与签字具有同等的法律效力。在签字可能存在争议或难以辨认的情况下，按手印可以作为一种补充手段，增强协议的证明力。
拍照留存：拍照留存协议签字按手印的过程，虽然不能直接决定协议的法律效力，但可以作为协议签订过程的证据之一。在发生纠纷时，拍照留存的照片可以作为辅助证据，帮助证明协议的真实性和签订过程。
二、协议有效性的其他关键因素
除了签字与按手印外，协议的有效性还取决于以下关键因素：
行为人具有相应的民事行为能力：双方当事人必须具备能够独立实施民事法律行为的资格。对于自然人，完全民事行为能力人可以独立签订协议；限制民事行为能力人实施的与其年龄、智力、精神健康状况相适应的或纯获利益的民事法律行为有效，其他需法定代理人同意或追认；无民事行为能力人实施的民事法律行为无效。对于法人和非法人组织，应在其核准登记的经营范围内或法律规定的权限范围内签订协议。
意思表示真实：协议必须是双方自愿、平等协商的结果，表示与内心真实意愿一致。如存在欺诈、胁迫等不正当手段导致一方在非自愿情况下签订协议，受损害方有权请求法院或仲裁机构撤销该协议。
协议内容合法合规：协议内容不得违反国家法律法规的强制性规定，也不能损害社会公共利益或他人合法权益。否则，该协议将被视为无效。例如，买卖毒品的协议因违反刑法而无效。同时，协议也不能违背社会公共秩序和善良风俗（公序良俗）。
三、实际操作建议
确保签字与按手印的真实性：在签订协议时，应确保双方当事人的签字和按手印是其真实意思表示，避免存在欺诈、胁迫等情形。
拍照留存作为辅助证据：虽然拍照留存不能直接决定协议的法律效力，但可以作为协议签订过程的证据之一。在签订协议时，可以拍照留存签字按手印的过程，以备不时之需。
咨询专业律师进行审查：如果对协议的有效性存疑或涉及重要权益，建议向我咨询，进行进一步的审查和评估，以确保自身权益不受损害。
举例说明：假设甲乙双方签订了一份买卖合同，并签字按手印后拍照留存。如果双方均具备完全民事行为能力，意思表示真实，且合同内容合法合规，那么这份合同就是有效的。即使在未来发生纠纷时，拍照留存的照片也可以作为辅助证据，帮助证明合同的真实性和签订过程。
综上所述，协议签字按手印拍照在大多数情况下是有效的，但具体有效性还需结合行为人能力、双方意愿、协议内容等多种因素进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。