取保候审期间打卡逾期，保证金是否退还需分情况讨论，核心结论如下：
若逾期次数较少且情节轻微，保证金通常可退还，但可能面临警告或训诫
根据《刑事诉讼法》第71条，被取保候审的犯罪嫌疑人、被告人需遵守“未经执行机关批准不得离开所居住的市、县”“在传讯时及时到案”等规定。打卡逾期若属于轻微违反规定（如因疏忽导致1-2次迟到），且未造成严重后果（如逃避侦查、串供等），公安机关可能仅给予口头警告或训诫，保证金仍会全额退还。但需注意，部分地区可能要求书面检讨或增加打卡频次作为补救措施。
若逾期次数较多或情节严重，保证金可能被没收，甚至面临更严厉处罚
若打卡逾期达3次以上，或伴随其他违规行为（如擅自离开居住地、干扰证人作证），公安机关可依据《刑事诉讼法》第71条第3款，没收部分或全部保证金，并视情节轻重责令具结悔过、重新交纳保证金、提出保证人，甚至变更强制措施（如监视居住、逮捕）。例如，某地案例中，被告人因5次打卡逾期且未及时报告行踪，最终被没收全部保证金并逮捕。
保证金退还与否，还需结合主观过错与后果综合判断
司法实践中，公安机关会重点审查违规行为的主观恶性（如故意拖延 vs. 客观原因导致）和实际后果（如是否影响案件侦查）。若逾期因不可抗力（如突发疾病、自然灾害）且及时补报，通常不影响保证金退还；但若因故意隐瞒行程、逃避监管导致逾期，即使次数较少，也可能被认定为“严重违反规定”，进而没收保证金。
建议：若您或家人涉及此类情况，需立即联系执行机关（如派出所）说明逾期原因，并提交书面材料（如医疗证明、交通延误记录等）证明非主观故意。若保证金已被没收，可在收到《没收保证金决定书》后5日内向作出决定的公安机关申请复议，或依法向同级人民检察院申诉。具体操作可进一步向我咨询，我会结合您的实际情况提供详细方案。