跨区侵占土地属于违法行为，需根据具体情况通过法律途径解决，包括协商、行政投诉、民事诉讼或刑事报案等。以下是具体分析：

1. 明确侵占性质与证据收集
   首先需确认土地权属（如国有土地使用权证、集体土地所有权证等），并收集侵占行为的证据，包括现场照片、视频、证人证言、土地权属证明文件等。若涉及跨区，需注意证据的合法性与关联性，例如侵占行为是否持续、是否造成实际损失等。

2. 协商与调解
   若侵占方为个人或企业，可尝试通过协商解决，明确要求返还土地并恢复原状。若协商无果，可申请当地人民调解委员会或基层政府介入调解，形成书面调解协议以增强执行力。

3. 行政投诉与查处

   • 向自然资源部门举报：根据《土地管理法》，侵占土地可能涉嫌非法占用土地，可向县级以上自然资源主管部门投诉，要求其依法查处（如责令退还、限期拆除、罚款等）。
     
   • 跨区协调机制：若侵占行为涉及不同行政区划，可向上级自然资源部门（如市级、省级）反映，或通过跨区域协作机制推动处理。

4. 民事诉讼

   • 物权保护诉讼：若土地权属明确，可直接向法院起诉，要求侵占方停止侵害、返还土地、赔偿损失（如土地收益损失、恢复费用等）。
     
   • 诉讼管辖：根据《民事诉讼法》，侵权行为地或被告住所地法院均有管辖权，跨区案件可选择更便利的法院起诉。

5. 刑事报案（如构成犯罪）
   若侵占行为情节严重（如非法占用基本农田五亩以上或基本农田以外的耕地十亩以上），可能涉嫌《刑法》第三百四十二条的非法占用农用地罪，可向公安机关报案，追究刑事责任。

6. 特殊情形处理

   • 历史遗留问题：若土地权属存在争议（如未确权、集体土地与国有土地重叠），需先通过行政确权程序明确权属，再主张权利。
     
   • 政府征地行为：若侵占系政府征地引发，需审查征地程序是否合法（如是否公告、是否补偿），若程序违法可提起行政复议或行政诉讼。

建议：跨区侵占土地案件往往涉及多方利益与复杂法律关系，建议根据具体情况选择合适途径，并提前咨询专业律师以制定策略。如有进一步问题，可直接向我提问。