结论前置：非法侵占6000元是否会立案，主要取决于侵占的具体情形和当地的司法实践标准。在多数情况下，若该行为不构成职务侵占罪，且未达到其他相关犯罪的立案标准，则一般不会立案；但若符合特定条件，如构成职务侵占罪且当地立案标准较低，或存在其他严重情节，则有可能立案。以下是对此问题的详细分析：
一、职务侵占罪的立案标准
全国性标准：
- 根据《最高人民法院、最高人民检察院关于办理贪污贿赂刑事案件适用法律若干问题的解释》及《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（二）》（2022修订），职务侵占罪“数额较大”的起点一般为六万元（部分地区可能为三万元以上）。因此，单纯从数额上看，6000元未达到全国性的职务侵占罪立案标准。
地区性差异：
- 尽管存在全国性标准，但部分地区可能根据经济发展水平、社会状况及司法实践，对职务侵占罪的立案追诉标准有所调整。例如，某些地区可能将立案标准设定为5000元至1万元以上。在这些地区，6000元的职务侵占行为有可能达到立案标准。
二、其他相关犯罪的立案标准
- 若非法侵占行为不构成职务侵占罪，但符合其他犯罪的构成要件，如盗窃罪、诈骗罪等，则需根据相应犯罪的立案标准来判断。例如，盗窃罪的立案标准通常较低，具体数额因地区而异，但一般远低于职务侵占罪的立案标准。若6000元的非法侵占行为符合盗窃罪的立案标准，则有可能被立案侦查。
三、特殊情节的影响
- 即使非法侵占的数额未达到立案标准，但若存在其他严重情节，如多次实施侵占行为、侵占救灾、抢险、防汛、优抚、扶贫、移民、救济款物等，仍有可能被立案追究刑事责任。
四、治安管理处罚与民事责任
治安管理处罚：
- 根据《治安管理处罚法》第四十九条，盗窃、诈骗、哄抢、抢夺、敲诈勒索或者故意损毁公私财物的行为，可处五日以上十日以下拘留，并可并处五百元以下罚款；情节较重的，处十日以上十五日以下拘留，并可并处一千元以下罚款。若非法侵占6000元的行为符合该条款规定，公安机关仍可依据该法对其进行处罚。
民事责任：
- 非法侵占行为损害了公司、企业或其他单位的财产权益，受害单位可以依据《民法典》等相关法律法规，要求侵占者承担民事赔偿责任，返还侵占的财产，并赔偿因其侵占行为所遭受的损失。
五、建议与指导
- 具体是否立案需结合当地法律法规、特殊情节及司法实践综合判断。若您面临此类问题，建议及时向我咨询，我会根据您的具体情况和当地司法实践，为您提供专业的法律意见。
- 同时，无论数额大小，非法侵占都是违法行为，应受到法律的制裁。若您发现此类行为，建议及时向相关部门举报或寻求法律援助。
综上所述，非法侵占6000元是否会立案，需根据具体情况和当地司法实践来判断。在处理此类问题时，应综合考虑多种因素，并寻求专业法律意见以确保合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。