行政机关限制市场准入是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 合法情形：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国行政处罚法》第九条，行政机关在特定情况下，有权采取限制开展生产经营活动等行政处罚措施。这通常发生在市场主体违反了相关法律法规，如未取得必要的许可证件、违反市场准入条件或从事违法经营活动时。
   • 具体情形：例如，某企业未取得环保部门的排污许可证就擅自排放污染物，环保部门有权依法限制其开展生产经营活动，直至其取得合法许可并整改到位。这种限制是合法的，旨在保护环境、维护市场秩序和公共利益。

2. 违法情形：

   • 无权限制：如果行政机关在没有明确法律依据或超越法定权限的情况下，擅自限制市场主体的准入或经营活动，则构成违法。例如，某地方政府为了保护本地企业，无端设置市场准入障碍，阻止外地企业进入本地市场，这种行为就违反了市场公平竞争的原则和法律法规。
   • 程序违法：即使行政机关有权限制市场准入，但如果未按照法定程序进行，如未进行听证、未告知当事人权利等，也可能构成违法。程序违法同样会损害市场主体的合法权益，影响行政行为的合法性和有效性。

法律建议：

• 对于市场主体：如果认为行政机关的限制市场准入行为违法，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。在申请复议或提起诉讼前，建议咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的法律后果。
• 对于行政机关：在采取限制市场准入等行政处罚措施时，必须严格遵守法律法规和法定程序，确保行政行为的合法性和有效性。同时，应加强与市场主体的沟通和解释工作，避免不必要的误解和纠纷。

可能后果：

• 如果行政机关的限制市场准入行为被认定为违法，可能会面临被撤销或变更的行政复议决定或行政判决，以及可能的国家赔偿责任。
• 对于市场主体而言，如果因行政机关的违法限制行为遭受损失，有权依法要求赔偿。

总结：行政机关限制市场准入是否违法，取决于是否有明确的法律依据、是否超越法定权限以及是否遵守法定程序。在遇到此类问题时，建议市场主体及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并依法维护自己的合法权益。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。