针对公司两次未出资的情况，核心处理方式需依据未出资股东的身份、公司章程约定及实际损害后果综合判断，主要分为内部追责与外部追责两个方向。以下分情况详细说明：

一、内部追责：股东之间的权利救济

1. 催告出资与股东会决议
   根据《公司法》第28条，股东未按期足额缴纳出资的，公司或其他股东可书面催告其限期缴纳。若股东仍不履行，公司可通过股东会决议对其权利进行限制（如限制分红权、表决权等），但需注意：

   • 限制内容需在公司章程中明确约定；
     
   • 决议程序需符合《公司法》及章程规定（如代表三分之二以上表决权股东通过）。

2. 解除股东资格（极端情况）
   若股东未出资且经催告后仍不缴纳，公司可通过股东会决议解除其股东资格，但需满足严格条件：

   • 仅适用于“完全未履行出资义务”或“抽逃全部出资”的情形；
     
   • 需经公司催告后合理期限内仍未缴纳；
     
   • 决议需经代表三分之二以上表决权股东通过；
     
   • 解除后需办理减资或由其他股东或第三人缴纳出资（否则可能面临债权人追责）。

3. 损害赔偿请求权
   未出资股东需对其他已出资股东承担违约责任（若章程或出资协议中有约定），或对公司承担赔偿责任（赔偿因未出资导致的公司损失，如融资成本增加、项目违约等）。

二、外部追责：对公司债权人的责任

1. 补充赔偿责任
   根据《公司法司法解释三》第13条，公司债权人可要求未出资股东在未出资本息范围内对公司债务不能清偿部分承担补充赔偿责任。若股东为发起人，还需对其他发起人的未出资行为承担连带责任。

2. 加速到期规则（未届出资期限时）
   若公司具备破产原因（如不能清偿到期债务且资产不足以清偿全部债务），债权人可申请公司破产，并要求未届出资期限的股东提前缴纳出资（依据《九民纪要》第6条）。

3. 人格否认（法人人格混同时）
   若股东未出资导致公司资本显著不足，且存在滥用公司法人独立地位逃避债务的行为，债权人可依据《公司法》第20条要求股东对公司债务承担连带责任。

三、实务建议

1. 核查公司章程与出资协议
   确认未出资股东的出资期限、违约责任等条款，为后续追责提供依据。

2. 固定证据链
   收集股东未出资的证据（如银行流水、验资报告、催告函等）及公司损失证明（如债权人催款函、诉讼材料等）。

3. 分层处理策略

   • 优先通过协商或股东会决议内部解决；
     
   • 若内部无效，及时启动诉讼程序，同时申请财产保全防止股东转移资产；
     
   • 若公司已陷入经营困境，可同步考虑破产重整或清算程序。

提示：未出资问题可能涉及刑事风险（如虚假出资罪），但需满足“数额巨大、后果严重”等条件，实务中较少见。若需进一步分析具体案情，可直接向我咨询。