民工在申请劳动仲裁时，仲裁机构可以依据《保障农民工工资支付条例》来定责。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
《保障农民工工资支付条例》是专门为了保障农民工工资支付而制定的行政法规，它明确了用人单位支付农民工工资的责任和义务，以及违反规定应承担的法律责任。在劳动仲裁过程中，仲裁机构会依据相关法律法规来审理案件，并作出裁决。因此，如果民工的工资支付问题涉及到该条例的相关规定，仲裁机构当然可以依据该条例来定责。
二、仲裁机构定责的依据
事实认定：仲裁机构会首先对案件的事实进行认定，包括民工是否提供了劳动、用人单位是否支付了工资、支付了多少工资等。这些事实的认定是定责的基础。
法律适用：在事实认定的基础上，仲裁机构会适用相关的法律法规来定责。如果民工的工资支付问题符合《保障农民工工资支付条例》的规定，那么仲裁机构就会依据该条例来判定用人单位的责任。
责任判定：根据事实认定和法律适用，仲裁机构会判定用人单位是否违反了《保障农民工工资支付条例》的规定，以及应承担何种法律责任。这包括支付拖欠的工资、加付赔偿金等。
三、民工在申请仲裁时的注意事项
提供证据：民工在申请仲裁时，应提供充分的证据来证明自己的主张，如劳动合同、工资条、考勤记录等。这些证据将有助于仲裁机构认定事实，并作出公正的裁决。
明确诉求：民工在申请仲裁时，应明确自己的诉求，如要求用人单位支付拖欠的工资、加付赔偿金等。明确的诉求将有助于仲裁机构理解民工的请求，并作出相应的裁决。
遵守程序：民工在申请仲裁时，应遵守相关的仲裁程序，如提交仲裁申请书、参加仲裁庭审等。遵守程序将有助于仲裁机构顺利审理案件，并作出公正的裁决。
四、可能的法律后果
如果用人单位被仲裁机构判定违反了《保障农民工工资支付条例》的规定，那么它可能面临支付拖欠的工资、加付赔偿金等法律后果。同时，用人单位的违法行为还可能被记入信用档案，对其未来的经营和发展产生不利影响。
总结来看，民工在申请劳动仲裁时，仲裁机构可以依据《保障农民工工资支付条例》来定责。民工在申请仲裁时，应提供充分的证据、明确自己的诉求，并遵守相关的仲裁程序。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。