员工诈骗工资数额达到3000元以上，一般即可立案，但具体立案标准可能因地区及案件特殊情节而有所调整。以下是对此问题的详细分析：
一、一般立案标准
诈骗罪定义与处罚：
- 诈骗罪是指以非法占有为目的，通过虚构事实或隐瞒真相的方法，骗取数额较大的公私财物的行为。
- 根据《中华人民共和国刑法》第二百六十六条的规定，诈骗公私财物，数额较大的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。
数额标准：
- 根据最高人民法院、最高人民检察院《关于办理诈骗刑事案件具体应用法律若干问题的解释》，诈骗公私财物价值三千元至一万元以上、三万元至十万元以上、五十万元以上的，应当分别认定为“数额较大”、“数额巨大”、“数额特别巨大”。
- 因此，员工诈骗工资数额达到3000元以上，通常即符合立案标准。但需注意，这一标准并非绝对，具体还需结合地区经济社会发展状况及案件特殊情节进行判断。
二、特殊情形与地区调整
特殊情节影响：
- 在某些特殊情况下，即使诈骗数额未达到一般的“数额较大”标准，也可能被立案追诉。例如，诈骗行为导致被害人精神失常、自杀等严重后果，或者诈骗残疾人、老年人等特定弱势群体的财物，以及属于诈骗集团首要分子等情形，都可能被视为“其他严重情节”或“其他特别严重情节”，从而触发立案程序。
地区标准调整：
- 考虑到各地区经济社会发展水平的差异，各省、自治区、直辖市高级人民法院、人民检察院有权在规定的数额幅度内，结合本地区实际情况，共同研究确定具体的立案标准，并报最高人民法院、最高人民检察院备案。
- 这意味着在不同地区，员工诈骗的立案标准可能会有所不同。例如，经济欠发达地区可能将3000元作为立案起点，而经济发达地区则可能提高至5000元或1万元。
三、实际操作建议
明确诈骗数额：
- 在遇到员工诈骗工资的情况时，首先应明确诈骗数额是否达到当地规定的立案标准。这可以通过咨询当地公安机关或查阅相关司法解释来确认。
关注特殊情节：
- 同时，也需关注是否存在特殊情节，这些情节可能影响案件的立案和处理结果。例如，诈骗行为是否导致严重后果、是否针对特定弱势群体等。
及时报案与保留证据：
- 若确认诈骗数额达到立案标准或存在特殊情节，应立即向公安机关报案，并提供相关证据材料，如聊天记录、转账记录、劳动合同等，以便公安机关进行调查取证。
- 在报案前，务必妥善保管好所有与诈骗行为相关的证据，确保证据的完整性和真实性。这些证据将对案件的侦破和后续的法律程序起到至关重要的作用。
寻求法律帮助：
- 在处理此类案件时，如有需要，可以向我咨询具体的法律程序和自身权益，以便更好地维护自己的合法权益。
综上所述，员工诈骗工资的立案标准并非一成不变，而是根据具体情况和地区差异有所调整。因此，在面对此类情况时，及时报案、保留证据并寻求法律帮助是保护自身权益、打击犯罪行为的重要途径。