在民间借贷纠纷中，若已经达成调解协议且该协议已经生效，通常情况下，当事人是不能就同一事实和理由再次起诉的。这是因为调解协议一旦生效，就具有了法律约束力，双方应当履行。不过，也存在一些特定情形，使得当事人有机会再次提起诉讼，以下是对这些情形的详细分析：
一、调解协议违法或违背公序良俗
如果调解协议的内容存在违法、违背公序良俗、侵害国家利益、社会公共利益或他人合法权益等情形，那么该调解协议是无效的。在这种情况下，当事人可以向法院申请撤销司法确认裁定（如果调解协议经过了司法确认），或者在发现协议无效后，直接就原纠纷另行起诉。
二、调解协议未履行或未完全履行
达成人民调解协议并司法确认：
- 如果双方在人民调解委员会等组织的主持下达成了调解协议，并且共同向法院申请了司法确认，法院也作出了确认调解协议有效的裁定，那么该裁定具有强制执行力。
- 若一方当事人拒绝履行或未全部履行调解协议，对方当事人可以向人民法院申请执行，而不是再次起诉。但这里要注意的是，执行的是调解协议的内容，而非重新提起诉讼。
法院主持调解并出具调解书：
- 如果在法院主持下达成了调解协议，并且法院制作了调解书并送达双方当事人，那么该调解书即发生法律效力，与生效判决具有同等效力。
- 若一方当事人不履行调解书确定的义务，对方当事人可以向法院申请执行。同样地，这里也不是再次起诉，而是执行调解书。
三、存在再审或撤销原裁定的情形
再审：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，如果当事人有证据证明调解违反自愿原则或者调解协议的内容违反法律，可以申请再审。
- 经人民法院审查属实的，应当再审，案件会重新进行审理。这意味着，在特定条件下，当事人有机会通过再审程序来重新解决纠纷。
撤销原裁定：
- 如果调解协议经过了司法确认，但后来发现调解协议存在违法或违背公序良俗等情形，当事人可以申请撤销司法确认裁定。
- 撤销后，当事人可以就原纠纷另行起诉。
四、发现新证据或调解协议存在明显错误
在某些特殊情况下，如发现新的证据或调解协议存在明显错误，当事人也可能有机会再次提起诉讼。但这需要符合严格的法律条件，并且情况较为少见。
五、处理建议
- 在考虑是否再次起诉之前，当事人应仔细研究之前的调解协议，评估履行的可能性以及再次起诉的法律风险和成本。
- 如有疑问或困惑，建议咨询专业律师以获取更具体、更准确的法律建议。律师可以根据当事人的具体情况和法律规定，提供针对性的解决方案。
综上所述，民间借贷纠纷在调解后的法律效力是明确的，当事人应严格遵守调解协议。但在特定情形下，也存在再次起诉的可能性。因此，在处理此类纠纷时，应充分了解相关法律规定并谨慎行事。