结论：因与邻居发生矛盾被拘留5天，是否会留下案底，取决于拘留的性质。如果是行政拘留，一般不会留下案底，但会留下违法记录；如果是刑事拘留且后续被判刑，则会留下案底。
分析说明：
行政拘留的情况：
- 定义：行政拘留是公安机关依法对违反行政管理秩序的公民采取的短期限制人身自由的处罚措施。
- 后果：行政拘留通常不会留下案底，但会留下违法记录，这些记录在公安机关内部是可以查询到的，不过一般不会对个人的日常生活产生太大影响，比如不会影响就业、升学等（特定职业如公务员、律师等可能受影响）。
- 例子：如果因为与邻居发生肢体冲突，被公安机关处以行政拘留5天，那么这5天的拘留记录就是行政拘留记录，不会构成案底。
刑事拘留且后续被判刑的情况：
- 定义：刑事拘留是刑事诉讼中的一种强制措施，用于确保犯罪嫌疑人或被告人在审判前不逃避或妨碍诉讼。如果后续被法院判刑，则构成犯罪记录。
- 后果：如果因为与邻居的矛盾升级为犯罪行为（如故意伤害罪等），被刑事拘留且后续被法院判刑，那么就会留下案底。案底是指个人因犯罪行为被法院判决后留下的犯罪记录，这会对个人的信用、就业、升学等产生严重影响。
- 例子：如果因为与邻居发生严重冲突，导致对方重伤或死亡，被公安机关刑事拘留，并最终被法院以故意伤害罪判刑，那么就会留下案底。
特殊场景：
- 如果只是被刑事拘留但未被判刑（如因证据不足、情节轻微等原因被释放或不起诉），那么不会留下案底，但刑事拘留的记录仍然会存在，且可能对个人产生一定影响（如影响某些职业的从业资格）。
行动建议：
- 如果您因为与邻居的矛盾被拘留，首先需要弄清楚拘留的性质是行政拘留还是刑事拘留。
- 如果是行政拘留，虽然不会留下案底，但也应反思自己的行为，避免再次违法。
- 如果是刑事拘留，且您认为自己没有犯罪或情节轻微，应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，积极配合调查，争取最好的法律结果。
法律背景：
- 根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定，行政拘留是对违反治安管理行为人的一种处罚措施。
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，刑事拘留是刑事诉讼中的一种强制措施，用于确保诉讼的顺利进行。
如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。