结论：中介要求将房产证存入其系统，这一行为本身并不直接违法，但必须建立在房东自愿且中介有合法、正当用途的前提之下。若房东不同意或中介存在不当使用房产证的情况，则可能涉及违法。

详细分析：

1. 自愿原则：

   • 房东作为房产的合法所有者，对其房产证享有完全的支配权。中介要求将房产证存入其系统，首先必须征得房东的明确同意。若房东不同意，中介无权强制要求或采取任何不当手段获取房产证。

2. 合法用途：

   • 中介要求房产证存入其系统，通常是为了进行房产信息的核实、租赁合同的备案或办理相关手续等合法目的。在这些情况下，中介应明确告知房东其用途，并确保房产证的使用符合相关法律法规的规定。
   • 若中介将房产证用于非法目的，如伪造证件、进行诈骗活动等，则不仅违法，还可能对房东造成严重的法律后果。

3. 安全保障：

   • 即使房东同意将房产证存入中介系统，中介也有义务确保房产证的安全，防止丢失、损坏或泄露给第三方。中介应采取必要的安全措施，如加密存储、限制访问权限等，以保障房东的合法权益。

4. 法律后果：

   • 若中介未经房东同意擅自获取或使用房产证，或将其用于非法目的，房东有权要求中介立即停止侵权行为，并可能追究其法律责任。这包括但不限于民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。

建议：

• 房东角度：在决定是否将房产证存入中介系统前，应仔细了解中介的信誉、资质和用途，并确保自己的权益得到充分保障。若对中介的请求有疑虑或担忧，可以拒绝或要求中介提供更详细的解释和保障措施。
• 中介角度：应尊重房东的意愿和权益，明确告知房产证的使用目的和保障措施，并确保合法、合规地使用房产证。若因不当使用房产证给房东造成损失的，应承担相应的法律责任。

后续行动：

• 若您作为房东遇到了中介要求将房产证存入其系统的情况，且对此有疑虑或担忧，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议和指导。
• 若您作为中介，在要求房东提供房产证时遇到了困难或问题，也可以向我咨询如何合法、合规地处理此事，以避免不必要的法律风险和纠纷。