发现药品入错单价后，应立即根据具体情况采取更正措施，以避免可能的法律风险和经济损失。具体处理方式需分情况讨论：

1. 若药品尚未销售或交付
   此时错误尚未产生实际影响，应第一时间修正系统或单据中的单价信息，并留存更正记录（如系统操作日志、书面更正说明）。若涉及与供应商或采购方的合同，需同步通知对方确认单价变更，避免后续争议。

2. 若药品已销售或交付，但未开具发票
   需立即联系购买方说明情况，协商重新确认价格并补签书面协议（如补充合同、价格确认单）。若购买方拒绝调整，可能面临合同违约风险，需评估是否需按原价履行或承担差价损失。

3. 若药品已销售且已开具发票

   • 增值税发票：需根据《增值税发票开具及使用规定》，在发现错误的当月收回原发票并作废，重新开具正确发票；若跨月或已认证，需开具红字发票冲销后重开。
     
   • 普通发票：直接收回原发票并注明“作废”，重新开具正确发票。
     
   • 若无法收回原发票：需与购买方协商出具书面说明（如《情况说明书》），证明单价错误事实，并留存证据以备税务核查。

4. 若涉及医保报销或政府定价药品
   需立即向相关部门（如医保局、物价局）报告错误，并按其要求补交材料或接受处罚。此类场景下，单价错误可能涉及行政责任（如罚款）或刑事责任（如诈骗罪，若故意虚报价格），需高度重视。

预防措施建议：

• 建立药品价格审核机制，在入库、销售环节设置双人复核流程；
  
• 定期核对系统价格与实际合同/政策要求的一致性；
  
• 对员工进行价格管理培训，明确错误更正流程及责任。
  

如有进一步疑问或需处理具体纠纷，可直接向我咨询，我会结合您的实际情况提供详细方案。