结论前置：购买二手房时合同上标注为“单位集体土地”，能否打官司需分情况讨论，具体如下：
若房屋本身合法且合同有效，仅因土地性质产生争议
根据《民法典》第209条，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记发生效力。若房屋已取得合法产权证（如“小产权房”中的合法部分），且合同内容不违反法律强制性规定（如未约定集体土地使用权转让），则合同有效。此时若因土地性质（如集体土地未转为国有）导致无法过户或产生其他纠纷，您有权通过诉讼主张权利，例如要求卖方履行合同义务、赔偿损失或解除合同并返还购房款。
若房屋或合同存在违法情形
- 集体土地使用权转让限制：根据《土地管理法》第63条，集体土地使用权原则上不得出让、转让或出租用于非农业建设，除非符合“土地利用总体规划并依法取得建设用地使用权”等例外情形。若房屋所在土地未依法转为国有，且合同直接约定转让集体土地使用权，则合同可能因违反法律强制性规定而无效。
- “小产权房”风险：若房屋属于未依法办理审批手续、未缴纳土地出让金等费用的“小产权房”，其交易本身不受法律保护。此时即使签订合同，也可能因标的违法导致合同无效，您难以通过诉讼主张权利（如要求过户），但可主张返还购房款（需以卖方存在过错为前提）。
诉讼策略建议
- 确认合同效力：首先需审查合同内容是否涉及集体土地使用权转让，若未涉及且房屋合法，可主张合同有效并要求履行；若涉及且土地未依法转化，则合同可能无效，需调整诉讼请求（如赔偿损失而非过户）。
- 收集证据：包括房屋产权证、土地性质证明（如集体土地使用证）、合同文本、付款凭证等，以证明交易事实及对方过错。
- 咨询专业律师：因集体土地纠纷涉及土地管理法、物权法等多部法律，且地方政策差异较大，建议委托律师分析具体案情，制定诉讼方案。
总结：能否打官司取决于房屋及合同的合法性。若交易合法，您可通过诉讼维权；若违法，则需根据具体情况调整策略。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律问题。