申请撤销宅基地证确实存在起诉期限的限制，具体期限需根据不同情况确定。以下分情况详细说明：

1. 若认为行政机关颁发宅基地证的行为违法，提起行政诉讼的期限
   根据《行政诉讼法》第四十六条规定，公民、法人或其他组织直接向法院提起诉讼的，应当自知道或应当知道行政机关作出行政行为之日起六个月内提出；若涉及不动产（如宅基地证）且自行政行为作出之日起超过二十年，法院将不予受理。
   例如：若您在2010年发现宅基地证登记错误，但直到2023年才起诉，因超过二十年最长保护期，法院可能驳回起诉。

2. 若通过行政复议后对结果不服，再提起行政诉讼的期限
   根据《行政诉讼法》第四十五条，经复议的案件，申请人可在收到复议决定书之日起十五日内向法院起诉；若复议机关逾期未作决定，申请人可在复议期满之日起十五日内起诉。
   例如：复议机关在2023年1月1日作出维持原证的决定，您需在2023年1月16日前起诉，否则可能丧失诉权。

3. 若宅基地证因继承、赠与等民事行为引发争议，提起民事诉讼的期限
   此时需适用《民法典》关于诉讼时效的规定：

• 一般民事纠纷诉讼时效为三年，自权利人知道或应当知道权利受损之日起计算；
  
• 若涉及不动产权利确认（如宅基地使用权归属），则不受诉讼时效限制，但需通过民事确权程序解决。
  例如：兄弟间因宅基地证登记错误发生继承纠纷，若自2020年知道登记错误，需在2023年前起诉主张权利；但若直接要求确认宅基地使用权归属，则无时效限制。

实务建议：

• 发现宅基地证问题后，尽快通过行政复议或诉讼主张权利，避免因期限届满丧失救济机会；
  
• 若涉及民事争议，需区分是“权利确认”还是“损害赔偿”，前者无时效限制，后者需在三年内主张；
  
• 具体操作中，建议携带宅基地证、行政文书等材料，由律师协助分析案情并制定诉讼策略。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律问题。