结论概述：复旦大学与内蒙古大学续签的对口合作协议中，双方在合作中需承担的法律责任主要涉及合同履行责任、违约责任及可能涉及的侵权责任。以下结合新闻背景，从这三个方面进行详细分析。

一、合同履行责任

1. 学科建设、人才培养等合作内容的履行：

   • 根据协议，双方将在学科建设、人才培养、师资引育、科学研究与社会服务等方面继续深化合作。这意味着双方需按照协议约定的内容、方式和期限，履行各自的义务。例如，复旦大学可能需提供学科建设指导、师资培训等支持，而内蒙古大学则需积极配合，确保合作项目的顺利实施。
   • 法律依据：根据《民法典》第五百零九条，当事人应当按照约定全面履行自己的义务。当事人应当遵循诚信原则，根据合同的性质、目的和交易习惯履行通知、协助、保密等义务。

2. 合作共建中的资源投入与共享：

   • 双方在合作共建中需投入各自的优势资源，如科研设备、人才资源等，并实现资源共享。这要求双方在合作过程中，需确保资源的有效利用和合理分配，避免资源浪费或不当使用。
   • 法律依据：同样依据《民法典》第五百零九条，双方需按照约定履行资源投入与共享的义务，确保合作项目的顺利进行。

二、违约责任

1. 未履行或未完全履行合作义务：

   • 若一方未按照协议约定履行合作义务，如未提供约定的支持、未按时完成合作项目等，则构成违约。违约方需承担违约责任，包括赔偿对方因此遭受的损失。
   • 法律依据：根据《民法典》第五百七十七条，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。

2. 违反保密义务或竞业禁止条款：

   • 若协议中包含保密义务或竞业禁止条款，双方需严格遵守。若一方违反这些条款，泄露合作秘密或从事与合作项目相竞争的活动，则需承担违约责任。
   • 法律依据：同样依据《民法典》的相关规定，违约方需承担因违反保密义务或竞业禁止条款而给对方造成的损失赔偿责任。

三、侵权责任

1. 因合作行为导致的第三方损害：

   • 在合作过程中，若因一方的行为导致第三方遭受损害，如科研实验中的安全事故、环境污染等，则该方需承担侵权责任。若双方均有过错，则根据过错程度承担相应的责任。
   • 法律依据：根据《民法典》第一千一百六十五条，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。依照法律规定推定行为人有过错，其不能证明自己没有过错的，应当承担侵权责任。

2. 知识产权侵权：

   • 在合作过程中，若涉及知识产权的创造、使用或转让，双方需确保不侵犯第三方的知识产权。若因一方的原因导致知识产权侵权，则该方需承担侵权责任。
   • 法律依据：依据《民法典》中关于知识产权侵权的相关规定，侵权方需承担停止侵害、赔偿损失等民事责任。

热点事件延伸思考

此次复旦大学与内蒙古大学续签对口合作协议，不仅体现了双方对教育科技人才一体化发展的重视，也为其他高校间的合作提供了借鉴。然而，合作过程中也可能面临各种法律风险和挑战。因此，双方在签订合作协议时，应充分考虑可能涉及的法律问题，明确各自的权利和义务，以规避潜在的法律风险。同时，在合作过程中，双方应加强沟通与协作，共同应对可能出现的法律问题，确保合作项目的顺利进行。

总结与建议：复旦大学与内蒙古大学在续签的对口合作协议中，需承担合同履行责任、违约责任及可能涉及的侵权责任。为确保合作项目的顺利进行，双方应严格遵守协议约定，加强沟通与协作，共同应对可能出现的法律问题。若遇到具体的法律问题或纠纷，可直接向我咨询，我将提供专业的法律意见和帮助。