在医疗事故中，关于持有执业医师证的医生如何赔偿的问题，这确实是一个涉及法律责任和赔偿流程的复杂议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、主要赔偿责任归属
首先，需要明确的是，在大多数情况下，医生在执行医疗职务行为过程中导致的医疗事故，主要赔偿责任是由其所在的医疗机构承担的。这是因为医生是在医院的安排和管理下进行医疗活动的，其职务行为代表的是医院。例如，医生在手术过程中因疏忽导致患者受损，若该手术是医院安排下的职务行为，那么患者的损失，如医疗费、误工费等，通常由医院负责赔偿。
二、医生可能承担的责任情形
尽管主要赔偿责任由医院承担，但在某些特定情况下，医生个人也可能需要承担相应责任：
医院内部追偿：如果医疗机构在对外赔偿后，发现医生在医疗事故中存在故意或重大过失，如严重违反诊疗规范、擅自离岗等，医院有权根据内部规定向医生进行追偿。
民事赔偿补充责任：在极少数特殊案件中，法院可能会根据具体情况判定医生对患者承担补充赔偿责任。这通常需要综合考虑医生的过错程度、患者的损害后果以及双方的经济状况等多方面因素。
行政处罚与刑事附带民事赔偿：如果医疗事故构成犯罪，如医生严重不负责任导致患者死亡或严重健康损害，医生将面临刑事处罚，并需承担刑事附带民事赔偿责任。这是最为严重的法律后果。
三、赔偿处理步骤
在处理医疗事故赔偿问题时，通常需要遵循以下步骤：
确定因果关系：首先需要审查医疗记录、诊断报告等证据，以证明患者的损害是由医生的医疗行为直接导致的。
评估损害程度：通过医疗鉴定、伤残评定等方式，确定患者的具体损害程度和应获得的赔偿金额。
协商或诉讼：双方可以尝试通过协商达成赔偿协议。如果协商不成，患者或其家属可以向法院提起诉讼，要求医生或医疗机构承担赔偿责任。
赔偿内容：赔偿内容通常包括医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金、精神损害抚慰金等多项费用。具体项目和金额需要根据患者的实际情况和法律规定来确定。
法律程序：如果选择诉讼途径，患者需要按照法定程序进行起诉、举证等。法院将依法审理案件，并作出公正的判决。
四、总结与建议
医疗事故赔偿问题复杂多变，涉及多个法律知识点和实际操作步骤。因此，在处理此类问题时，我建议您或医疗机构及时咨询专业律师或法律机构，以获取具体的法律建议和帮助。同时，双方应积极配合调查，明确责任归属，以便尽快达成合理的赔偿协议或通过法律途径解决争议。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时告诉我。