结论前置：当公司法人离职后公司不配合进行变更时，您可以通过查阅公司章程、沟通协商、发出书面通知、向登记机关投诉以及提起诉讼等途径来维护自己的合法权益。

一、查阅公司章程与相关协议

1. 公司章程的重要性：公司章程是公司的基本法律文件，其中详细规定了法定代表人变更的程序和条件。您需要仔细查阅公司章程，了解变更的具体流程，比如是否需要股东会或董事会决议，以及相关的表决比例要求。
2. 检查相关协议：同时，您还应检查劳动合同或任职协议中是否有关于离职及法定代表人变更的特别约定。这些约定可能对您的离职和变更流程产生直接影响。

二、与公司相关方沟通协商

1. 与股东沟通：您可以通过正式书面函件或会议的方式，向股东说明您的辞职原因和意愿。强调继续担任法定代表人可能带来的风险，如债务违约导致的法律责任等，争取股东的理解和支持。
2. 与管理层沟通：与高级管理人员进行沟通，说明变更的必要性和重要性。促使他们积极推动变更事宜，以便尽快完成变更手续。

三、发出书面通知并保留证据

1. 正式书面通知：如果沟通无果，您应向公司及其他股东发出正式的书面通知，明确表达您辞去法定代表人职务的意愿。同时，要求公司在一定期限内（如30天）办理变更登记手续。
2. 保留证据：在发送通知时，务必保留好通知的送达凭证，如快递单号、签收记录等。这些证据在后续可能出现的法律纠纷中将起到关键作用。

四、向登记机关投诉

1. 法律依据：根据《公司法》及相关行政法规，公司登记机关有权对公司进行监督和管理。如果公司不按规定办理变更登记，您可以向登记机关投诉。
2. 操作建议：携带辞职证明、公司章程等相关文件，向工商局等登记机关投诉公司不按规定办理变更登记的情况。登记机关有权进行调查，并责令公司限期改正。

五、提起诉讼

1. 法律依据：若公司拒绝配合变更，您有权向有管辖权的人民法院提起诉讼，请求法院判决公司协助办理变更登记手续。
2. 证据准备：在诉讼过程中，您需要准备辞职证明、公司章程、沟通记录、书面通知的送达凭证等证据。这些证据将用于证明您已提出辞职且公司拒不配合变更的事实。
3. 诉讼流程：提起诉讼后，法院将根据双方提供的证据和陈述进行审理。如果法院支持您的诉求，将作出要求公司办理法定代表人变更登记的判决。如果公司仍不履行判决，您可以向法院申请强制执行。

六、注意事项

1. 证据保留：在整个处理过程中，务必保留好所有沟通记录、函件、证据材料等。这些证据在后续可能出现的法律纠纷中将起到至关重要的作用。
2. 持续关注：离职后，您应持续关注公司动态，确保自己的权益不受侵害。如果发现公司有违规行为或可能对您产生不利影响的行为，应及时采取措施进行应对。

总结与建议：面对公司不配合变更法定代表人的问题，您应通过合理的沟通和合法的手段来逐步解决。保持冷静和理性，遵循法律法规，您将能够成功维护自己的合法权益。如果在这个过程中遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我将为您提供专业的法律帮助。