若农村垒护坡的行为占用了农民的树木和井，农民可以通过法律途径维护自身权益，具体可采取以下措施：

1. 确认侵权主体与侵权事实

   • 首先，需要明确垒护坡的具体实施主体，如村委会、政府相关部门或第三方施工单位等。
   • 收集证据证明垒护坡行为确实占用了农民的树木和井，包括现场照片、视频、证人证言等，以及树木和井的权属证明（如林权证、土地使用证、井的建造证明等）。

2. 协商与调解

   • 在确认侵权事实后，可以尝试与侵权主体进行协商，寻求和解或补偿方案。
   • 若协商无果，可以请求当地的人民调解委员会或相关政府部门进行调解，以达成双方都能接受的解决方案。

3. 提起民事诉讼

   • 若协商和调解均未能解决问题，农民可以向人民法院提起民事诉讼，要求侵权主体停止侵害、恢复原状、赔偿损失等。
   • 在诉讼过程中，需要提交充分的证据证明侵权事实、损失情况以及因果关系等，以支持自己的诉讼请求。
   • 诉讼请求可以包括要求侵权主体赔偿因占用树木和井而造成的直接经济损失（如树木的价值、井的修复费用等），以及可能产生的间接经济损失（如因井被占用而导致的灌溉困难所造成的农作物减产损失等）。

4. 关注行政诉讼可能性（如适用）

   • 如果垒护坡行为是政府相关部门基于行政行为而实施的，且该行为被认定为违法或不当，农民还可以考虑提起行政诉讼，要求撤销或变更该行政行为，并可能获得相应的行政赔偿。
   • 但需注意，行政诉讼的提起需满足一定的条件，如行政行为确实侵犯了农民的合法权益、农民已先行提起行政复议（如法律要求）等。

在采取法律行动前，建议农民：

• 咨询专业律师，以获取更具体、更专业的法律建议和指导。
• 确保所有证据的合法性和有效性，避免在诉讼过程中因证据问题而处于不利地位。
• 保持冷静和理性，通过合法途径维护自己的权益，避免采取过激行为或违法手段。