当公司在劳动仲裁期间注销时，劳动者不必过于担心，仍可通过以下途径来维护自己的合法权益：
一、明确公司注销的合法性及责任主体
查询公司注销状态及清算程序合法性：
- 劳动者应首先通过国家企业信用信息公示系统或其他官方渠道，核实公司是否已完成注销，以及注销前是否进行了合法的清算程序，如成立清算组、发布清算公告等。
- 若清算程序存在瑕疵，如未依法通知劳动者参与清算，劳动者可据此向相关责任人主张权利。
确定责任主体：
- 清算组成员：若清算组未按法定程序通知债权人，导致劳动者未能及时申报债权，清算组成员需承担赔偿责任。
- 股东：若股东在公司存在债务时恶意注销（如虚假清算、转移资产），需对公司债务承担连带责任。
- 其他关联方：如实际控制人或关联公司通过不正当手段导致公司注销，也可追究其责任。
二、根据注销阶段采取相应对策
劳动仲裁前公司已注销：
- 劳动者可将公司权利义务的承继者或有关责任人列为被申请人，向仲裁机构请求裁决。
仲裁过程中公司注销：
- 劳动者可变更或增加被申请人，请求有关责任人来履行生效的仲裁裁决。
- 同时，劳动者应继续向仲裁委员会申请执行已生效的裁决，并申请将责任主体变更为确定的股东、出资人等。
劳动仲裁后公司注销：
- 劳动者需首先确认公司注销是否合法合规，特别是清算程序是否依法进行，并是否通知了作为债权人的劳动者。
- 若清算程序存在瑕疵，劳动者可向清算组成员主张权利，要求其承担赔偿责任。
- 若公司已依法进行清算，但劳动者仍未能获得应有赔偿，劳动者可向法院申请追加相关主体为被执行人，通过执行程序实现权益。
三、法律程序的具体操作
收集证据：
- 劳动者应保留所有与公司注销和劳动仲裁相关的证据和文件，如劳动合同、工资流水、仲裁申请书、公司注销证明、股东信息等。
申请变更或增加被申请人：
- 劳动者应及时向劳动仲裁委提交书面申请，说明公司注销情况，并申请将责任主体变更为确定的股东、出资人等。提供相关证据材料以供核实。
提起诉讼：
- 若对仲裁结果不满意或仲裁机构因被申请人主体不存在而不予受理案件，劳动者有权在规定时间内向人民法院提起诉讼。
- 在诉讼中，劳动者应围绕责任主体的认定和自身权益进行举证和辩论。
申请强制执行：
- 若相关责任人未履行仲裁裁决或法院判决，劳动者可向人民法院申请强制执行，并提供必要证据。
- 在执行过程中，劳动者可申请冻结责任主体的财产，防止其转移资产。
四、行政救济途径
- 劳动者也可向工商行政管理部门反映公司违法注销的情况。工商部门有权对违法注销行为进行调查和处理，并可能责令恢复公司登记或采取其他行政措施。
五、注意事项
- 时效问题：劳动争议仲裁时效为一年，需在法定期限内主张权利；诉讼时效一般为三年，从知道或应当知道权利被侵害之日起计算。
- 保留证据：在整个维权过程中，劳动者应保留所有相关证据和文件，以备不时之需。
- 及时沟通：劳动者应保持与相关部门和机构的沟通，确保自己的诉求得到妥善处理。
示例说明：
假设某公司在劳动仲裁期间未经合法清算即注销，且拖欠员工工资。员工可采取以下行动：
- 查询工商档案，确认清算组未通知债权人；
- 以清算组成员和股东为被告提起诉讼，提交工资欠条、劳动合同等证据；
- 申请财产保全，冻结股东名下银行账户；
- 若胜诉后仍未获赔偿，申请强制执行。
综上所述，公司在劳动仲裁期间注销并不意味着劳动者的权益无法得到保障。劳动者应根据具体情况采取不同的措施来维护自己的合法权益，并在必要时寻求我的专业法律帮助。