代收代付协议本身并不违法，但其合法性取决于具体情形和是否满足相关条件。以下是对此问题的详细分析：
合法有效的代收代付协议
有真实交易基础：
- 代收代付协议应基于真实的交易关系而订立。例如，在国际贸易中，第三方银行代收代付货款，旨在保障交易的顺利进行。这种基于真实交易基础的代收代付行为，是被法律所认可的。
符合法律法规和监管要求：
- 协议内容需符合国家法律法规的规定，不违反金融监管部门的相关要求。例如，企业间因正常业务往来而委托代收代付相关费用，只要在税务处理、资金流向等方面均按规定操作，即属合法。
- 符合开展代收代付业务资质的机构包括银行业金融机构和取得《支付业务许可证》的支付机构，且支付机构的业务范围应当包含相应的网络支付。
自愿签订且无欺诈、胁迫：
- 协议的签订应是双方自愿的，不存在欺诈、胁迫等不正当手段。双方应充分了解协议的内容和后果，确保协议的合法性和有效性。
可能违法的代收代付协议
涉嫌洗钱：
- 若代收代付的资金来源不合法，或协议被用于掩饰、隐瞒犯罪所得及其收益的来源和性质，则可能构成洗钱犯罪。例如，通过签订虚假的代收代付协议将违法所得混入正常资金往来中，以图合法化。
非法金融活动：
- 未经金融监管部门批准，擅自从事经常性的代收代付业务，可能被视为非法金融活动。如无支付牌照的机构以代收代付为名开展类似第三方支付平台的业务，吸收并管理大量资金，即违反金融监管规定。
逃税漏税：
- 利用代收代付协议逃避纳税义务是违法的。例如，通过虚构代收代付业务将收入转移到其他账户以减少应纳税所得额，即违反税收法律法规。
侵犯他人权益：
- 在代收代付协议的签订和履行过程中，若侵犯了他人的合法权益（如财产权），也可能导致协议违法。如未获授权擅自代他人收取款项并据为己有，即构成对他人财产的侵犯。
实际应用中的建议
- 确保协议内容合法合规：在签订代收代付协议前，务必确保协议内容合法、真实有效，并严格遵守相关法律法规和监管要求。
- 明确双方权利和义务：协议中应明确约定代收代付的事项、金额、支付方式、支付时间等具体内容，以及双方的权利和义务。
- 谨慎选择合作方：选择具有合法资质和良好信誉的合作方，避免与存在违法违规行为的机构或个人签订代收代付协议。
- 保留相关证据：在协议履行过程中，保留好相关证据，如转账记录、收据、协议文本等，以备不时之需。
总结来说，代收代付协议的合法性取决于具体情形和是否满足相关条件。在签订和履行协议时，务必谨慎行事，确保协议的合法性和安全性。如有任何疑问或不确定情况，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见。