结论概述：车抵押逾期几天被扣2000保证金是否合理，需依据抵押合同的具体条款以及相关法律法规来判断。若合同中有明确约定逾期扣款条款且该条款不违反法律强制性规定，则扣款行为可能合法；若合同无约定或约定违法，则扣款行为可能不合法。

一、合同条款的审查

1. 合同约定：首先，需要仔细审查抵押合同中关于逾期还款及保证金扣款的条款。如果合同中明确规定了逾期还款将扣除一定金额的保证金，并且该条款在签订时已经向您进行了充分的说明和解释，您也表示了同意，那么根据合同法的原则，该条款对双方均具有约束力。在此情况下，扣款行为可能被视为合法。

2. 条款合法性：然而，即使合同中有相关约定，也需要确保该条款不违反法律、行政法规的强制性规定。例如，如果合同中约定的扣款金额过高，超出了合理范围，或者扣款方式违反了公平、诚信原则，那么该条款可能被视为无效。在此情况下，您有权要求返还被扣的保证金。

二、法律法规的适用

1. 《民法典》相关规定：根据《中华人民共和国民法典》中关于抵押权和合同法的相关规定，抵押权人在债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的实现抵押权的情形时，有权就抵押财产优先受偿。但是，这并不意味着抵押权人可以随意扣款或采取其他不当措施。抵押权人行使权利时，应当遵循法律、行政法规的规定，不得损害抵押人的合法权益。

2. 扣款行为的合法性：在车抵押逾期的情况下，抵押权人（如银行或金融机构）通常有权根据合同约定采取一定的措施来保障其债权。但是，这些措施必须合法、合理，并且不得违反法律、行政法规的强制性规定。如果扣款行为缺乏合同依据或违反了法律规定，那么您有权要求返还被扣的保证金，并可能追究抵押权人的法律责任。

三、实际操作建议

1. 审查合同：建议您首先仔细审查抵押合同中的相关条款，了解逾期还款及保证金扣款的具体规定。

2. 与抵押权人沟通：如果您认为扣款行为不合理或存在争议，可以与抵押权人进行沟通协商，寻求解决方案。在沟通过程中，您可以要求抵押权人提供扣款的合法依据和计算方式。

3. 寻求法律援助：如果沟通无果或您认为自己的权益受到了侵害，可以寻求专业律师的法律援助。律师可以帮助您分析合同条款的合法性、评估扣款行为的合理性，并为您提供相应的法律建议和支持。

四、可能面临的法律后果

1. 如果扣款行为合法：如果扣款行为符合合同约定且不违反法律规定，那么您可能需要接受这一结果，并按照合同约定履行还款义务。

2. 如果扣款行为不合法：如果扣款行为缺乏合同依据或违反了法律规定，那么您有权要求返还被扣的保证金，并可能追究抵押权人的法律责任。在此情况下，您可以通过法律途径来维护自己的合法权益。

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