违规取得多处宅基地使用证的处理方式需根据具体违规情形及现行法律规定综合判断，核心结论如下：

1. 确认违规性质与法律后果
   根据《土地管理法》第六十二条，农村村民一户只能拥有一处宅基地，其宅基地面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准。若通过隐瞒家庭成员情况、伪造证明材料、重复申请等手段违规取得多处宅基地使用证，属于违法行为，可能面临以下后果：

   • 行政处罚：县级以上人民政府土地行政主管部门可责令退还非法占用的土地，限期拆除在非法占用土地上新建的房屋（依据《土地管理法》第七十七条）；
     
   • 证书撤销：原发证机关可依职权或经利害关系人申请，撤销违规发放的宅基地使用证（依据《行政许可法》第六十九条）；
     
   • 刑事责任：若违规行为涉及贪污、贿赂、滥用职权等，可能构成犯罪，依法追究刑事责任（依据《刑法》第三百八十二条、第三百九十七条等）。

2. 分情形处理建议

   • 情形一：已取得多证但未实际使用
     若违规取得的多处宅基地均未建房或未实际使用，建议主动向发证机关说明情况，申请注销多余证书，避免行政处罚风险。若已建房但未超面积标准，可协商保留一处宅基地，其余退还集体并申请补偿。
     
   • 情形二：已实际使用多处宅基地
     若已建房且超出“一户一宅”标准，需根据地方政策处理：
     
     • 部分地区允许有偿退出：如浙江、安徽等地试点“宅基地有偿退出机制”，可自愿将多余宅基地退还集体，获取补偿；
       
     • 强制拆除风险：若拒绝退出且违反规划，可能面临强制拆除，建议提前与政府部门协商整改方案。
       
   • 情形三：证书存在程序瑕疵（如发证机关越权、未公示等）
     可依法申请行政复议或提起行政诉讼，主张撤销违规证书（依据《行政复议法》第十二条、《行政诉讼法》第十二条）。

3. 关键证据与程序

   • 证据收集：需证明违规事实（如申请材料造假、隐瞒家庭成员等），可通过调取档案、证人证言等方式固定证据；
     
   • 程序合法性审查：核查发证机关是否履行法定程序（如公示、听证等），若程序违法，证书效力可能被否定；
     
   • 协商与诉讼选择：优先通过协商解决，若协商无果，可依法提起行政诉讼或民事诉讼（如涉及侵权纠纷）。

提示：宅基地问题涉及地方政策差异，建议结合具体省份的《农村宅基地管理办法》进一步分析。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程及风险防范。