核心结论：借调在总部后被辞退的赔偿问题，需根据借调协议约定、劳动关系归属及辞退合法性等因素综合判断，具体分以下几种情况：

1. 若借调协议明确约定劳动关系保留在原单位，且辞退行为由原单位作出

   • 合法辞退：若原单位以《劳动合同法》第39条（如严重违纪、被追究刑事责任等）或第40条（如医疗期满不能工作、不能胜任工作等）为由辞退，需支付经济补偿金（按工作年限，每满1年支付1个月工资；违法解除则需支付2倍赔偿金）。
     
   • 违法辞退：若原单位无合法理由辞退（如未提前30日通知且无法定事由），需支付2倍经济补偿金的赔偿金。
     
   • 关键点：需确认原单位是否履行法定程序（如通知工会、出具解除证明等），否则可能构成违法解除。

2. 若借调期间劳动关系已实际转移至总部，且辞退行为由总部作出

   • 合法辞退：总部需按《劳动合同法》规定支付经济补偿金或赔偿金（标准同上）。
     
   • 违法辞退：若总部未履行法定程序或无合法理由辞退，需支付2倍赔偿金。
     
   • 关键点：需证明劳动关系已转移（如借调协议约定、社保缴纳记录、工资发放主体等），否则可能仍由原单位承担责任。

3. 若借调协议未明确劳动关系归属，或存在“逆向借调”（总部直接用工但未签合同）

   • 事实劳动关系认定：若总部实际用工但未签合同，可能被认定为事实劳动关系，总部需支付未签合同的双倍工资差额（最多11个月）及违法解除赔偿金。
     
   • 原单位责任：若原单位仍发放工资、缴纳社保，可能需与总部承担连带责任（需结合具体证据判断）。
     
   • 关键点：需收集工资流水、考勤记录、工作证等证据证明实际用工关系。

行动建议：

1. 核查证据：立即收集借调协议、劳动合同、工资记录、社保缴纳证明、辞退通知等材料，明确劳动关系归属及辞退理由。
   
2. 协商解决：与原单位或总部协商赔偿方案，要求出具书面解除证明并明确赔偿金额。
   
3. 申请仲裁：若协商无果，可在1年内向劳动仲裁委申请仲裁，主张经济补偿金、赔偿金或未签合同差额等。
   
4. 注意时效：劳动争议仲裁时效为1年，自知道或应当知道权利被侵害之日起计算，逾期可能丧失胜诉权。

温馨提示：借调纠纷常涉及劳动关系交叉，建议根据具体证据选择维权主体。如有疑问，可直接向我咨询，我会结合您的材料进一步分析。