若小诊所因非法配药行为被查处，需根据具体违法情节承担行政责任或刑事责任，同时可能面临民事赔偿。以下分情况说明处理方式及法律依据：

1. 行政责任：未取得资质或超范围配药
   根据《中华人民共和国药品管理法》第一百一十五条，未取得药品生产许可证、药品经营许可证或医疗机构制剂许可证生产、销售药品的，责令关闭，没收违法生产、销售的药品和违法所得，并处违法生产、销售的药品（包括已售出和未售出的药品）货值金额十五倍以上三十倍以下的罚款；货值金额不足十万元的，按十万元计算。
   若诊所已取得医疗机构执业许可证但超范围配药，可能依据《医疗机构管理条例》第四十七条，由县级以上人民政府卫生行政部门责令改正，给予警告，并处1万元以上10万元以下罚款；情节严重的，吊销其《医疗机构执业许可证》或责令停止执业活动。

2. 刑事责任：生产、销售假药或劣药

   • 假药情形：若配制的药品以非药品冒充药品，或以他种药品冒充此种药品，或变质、被污染的药品，或未取得药品批准证明文件生产、进口的药品，可能构成《刑法》第一百四十一条规定的生产、销售假药罪。
     处罚标准：足以严重危害人体健康的，处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；对人体健康造成严重危害或有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；致人死亡或有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或死刑，并处罚金或没收财产。
     
   • 劣药情形：若药品成分含量不符合国家药品标准，或被污染、未标明有效期等，可能构成《刑法》第一百四十二条规定的生产、销售劣药罪。
     处罚标准：对人体健康造成严重危害的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；后果特别严重的，处十年以上有期徒刑或无期徒刑，并处罚金或没收财产。

3. 民事赔偿：患者因用药受损
   若患者因使用诊所配制的药品导致人身损害，可依据《民法典》第一千二百一十八条，要求诊所承担医疗损害赔偿责任。赔偿范围包括医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入；造成残疾的，还应赔偿辅助器具费和残疾赔偿金；造成死亡的，还应赔偿丧葬费和死亡赔偿金。

建议处理步骤：

1. 立即停止违法行为：若诊所仍在配药或销售药品，需第一时间停止，避免违法情节加重。
   
2. 配合调查：主动向卫生健康行政部门或公安机关说明情况，提供相关药品来源、配制记录等证据，争取从轻处理。
   
3. 协商赔偿或应诉：若患者提出索赔，可协商解决；若进入诉讼程序，需准备医疗记录、药品检验报告等证据，证明自身无过错或过错程度较低。
   

提示：法律责任需结合具体案情判断，如涉及刑事犯罪，建议尽快委托律师介入，制定辩护策略。若有进一步问题，可直接向我咨询。