在办理涉嫌违纪违法案件中，违纪款由地方监委代为收缴是有明确依据的。以下从多个角度对此问题进行详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国监察法》的相关规定，监察机关在办理违纪违法案件时，有权对涉嫌违法取得的财物进行查封、扣押、冻结，并依法予以没收、追缴或者责令退赔。这一规定为地方监委代为收缴违纪款提供了明确的法律基础。具体来说，当监察机关在调查过程中发现违纪违法所得时，有权采取相应措施进行处置，以确保违纪违法所得不被转移、隐匿或挥霍，从而维护法律的严肃性和公正性。

二、实际操作

在实际操作中，地方监委在办理涉嫌违纪违法案件时，会依据相关法律法规和程序，对违纪款进行代为收缴。这一过程中，监委会严格遵循法定程序，确保收缴行为的合法性和合规性。例如，监委会在收缴违纪款前，会进行充分的调查取证，确认违纪款的来源和性质；在收缴过程中，会制作详细的收缴清单，并由相关人员签字确认；在收缴后，会及时将违纪款上缴国库或按照相关规定进行处理。

三、监督与制约

地方监委在代为收缴违纪款的过程中，也受到严格的监督和制约。一方面，监委内部设有专门的监督机构，对收缴行为进行全程监督，确保收缴行为的公正性和透明性；另一方面，监委的收缴行为也接受外部监督，如人大监督、司法监督等，以确保收缴行为的合法性和合规性。此外，如果监委在收缴过程中存在违法行为或不当行为，相关责任人员将依法承担相应的法律责任。

四、案例支持

在实际案例中，地方监委代为收缴违纪款的行为也得到了广泛的应用和认可。例如，在某些贪污受贿案件中，监委在调查过程中发现了涉案人员的违纪违法所得，并依法进行了代为收缴。这些案例不仅证明了地方监委代为收缴违纪款的合法性和合规性，也展示了监委在打击违纪违法行为、维护法律尊严方面的积极作用。

总结与建议：

地方监委在办理涉嫌违纪违法案件中代为收缴违纪款是有明确法律依据的，且在实际操作中得到了广泛的应用和认可。如果您或您身边的人遇到类似问题，或者对地方监委代为收缴违纪款的具体程序、监督机制等方面有疑问，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业的法律意见和帮助。