当员工在医疗期满后，如果用人单位因特定原因需要辞退该员工，其补偿方式主要依据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规进行。以下是对医疗期过后被辞退赔偿标准的详细解答：
一、合法辞退的赔偿标准
经济补偿金：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，如果劳动者在医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作，用人单位依法解除劳动合同的，应当向劳动者支付经济补偿金。
- 经济补偿金的计算方式为：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
- 月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。如果劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，那么经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
代通知金（如适用）：
- 如果用人单位没有提前三十日以书面形式通知劳动者本人就解除劳动合同，那么除了经济补偿金外，还需要额外支付劳动者一个月工资作为代通知金。但需注意，并非所有合法辞退情形都需支付代通知金，具体取决于解除劳动合同的原因和程序。
二、违法辞退的赔偿标准
- 如果用人单位违反法律规定辞退劳动者，那么属于违法解除劳动合同。
- 根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位应当依照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。即赔偿金等于经济补偿金乘以2。
三、特殊情形的处理
医疗期内的辞退限制：
- 劳动者在医疗期内，除非存在严重违反用人单位规章制度等法定情形，否则用人单位不得随意解除劳动合同。
- 如果用人单位在医疗期内违法辞退劳动者，那么将承担更严重的法律后果，包括支付高额赔偿金等。
协商一致的辞退：
- 如果用人单位与劳动者协商一致解除劳动合同，那么经济补偿金的支付标准可以参照合法辞退的相关规定执行，但具体金额可以由双方协商确定。
四、实际操作建议
- 了解当地政策：由于不同地区的劳动法规可能存在差异，因此在实际操作中，建议用人单位和劳动者都先了解当地的具体政策和规定。
- 保留相关证据：无论是用人单位还是劳动者，在处理此类问题时都应保留好相关证据，如医疗证明、劳动合同、工资单等，以便在发生争议时能够维护自己的合法权益。
- 协商解决：在可能的情况下，双方可以通过协商的方式解决争议，避免不必要的法律纠纷。
综上所述，医疗期过后被辞退的赔偿标准主要依据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规进行，具体赔偿金额和方式需根据实际情况和当地政策来确定。希望以上解答能够对您有所帮助。