房屋租赁合同中约定违约赔偿12个月租金是否合法，需分情况讨论：
若合同双方自愿协商一致，且该条款不违反法律强制性规定：
- 根据《民法典》的相关规定，合同双方有权在平等、自愿的基础上约定违约责任，包括违约金的数额或计算方式。因此，如果租赁双方在签订合同时，经过充分协商，一致同意将违约赔偿设定为12个月的租金，并且这一约定没有违反法律、行政法规的强制性规定，也没有违背公序良俗，那么该约定是合法的，对双方均具有约束力。
若合同约定的违约金过高，可能面临调整：
- 尽管合同双方可以约定违约金，但根据《民法典》第五百八十五条的规定，如果约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。这意味着，如果12个月的租金作为违约金明显超过了因违约行为给守约方造成的实际损失，那么违约方有权请求法院或仲裁机构对违约金数额进行调整。
- 调整标准：通常，法院或仲裁机构会考虑违约造成的实际损失、合同履行情况、当事人过错程度以及预期利益等因素，综合判断违约金是否过高，并据此作出调整。
实际操作建议：
- 对于承租人：在签订租赁合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于违约责任的部分。如果认为违约金约定过高，可以与出租人协商修改，或者要求在合同中明确违约金的调整机制。
- 对于出租人：同样需要谨慎设定违约金条款，避免约定过高而难以得到法院或仲裁机构的支持。同时，在出租房屋时，也应充分了解承租人的信用状况和履约能力，以降低违约风险。
总结来说，房屋租赁合同中约定违约赔偿12个月租金是否合法，取决于合同双方的协商结果以及该约定是否违反法律强制性规定。如果双方自愿协商一致，且该约定合法有效，那么该约定是合法的；但如果违约金过高，可能面临法院或仲裁机构的调整。因此，在签订租赁合同时，双方应充分协商、谨慎设定违约金条款。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。