灌溉水渠如果占用农民宅基地，这一行为通常是违法的。以下从多个角度进行分析：
一、法律依据与解释
《中华人民共和国水法》的相关规定：
- 第七条虽然主要规定了水资源的取水许可和有偿使用制度，但强调了国家对水资源的保护，并不意味着可以随意占用或破坏水利设施，包括灌溉水渠。
- 第三十七条明确禁止在江河、湖泊、水库、运河、渠道内弃置、堆放阻碍行洪的物体和种植阻碍行洪的林木及高秆作物。这一规定同样适用于农村灌溉水渠，任何单位和个人不得擅自占用或堵塞水渠，以确保水流的畅通和灌溉功能的正常发挥。
《中华人民共和国刑法》的相关规定：
- 第二百七十六条规定，由于泄愤报复或者其他个人目的，毁坏机器设备、残害耕畜或者以其他方法破坏生产经营的，构成破坏生产经营罪。如果灌溉水渠的占用行为导致农业生产受到严重影响，且行为人具有破坏生产经营的主观故意，那么该行为可能构成此罪。
地方性法规和政策：
- 各地根据实际情况制定了关于农田水利设施保护的具体规定。例如，某些地方性法规可能明确规定，未经主管部门批准，任何单位和个人不得占用水利工程设施，包括灌溉水渠。违反者将承担法律责任，包括行政处罚和民事赔偿等。
二、违法行为的后果
行政责任：
- 根据《中华人民共和国水法》第六十六条的规定，对于侵占、毁坏水工程及堤防、护岸等有关设施的行为，县级以上人民政府水行政主管部门或者流域管理机构有权责令停止违法行为，采取补救措施，并处以一万元以上五万元以下的罚款。
刑事责任：
- 如果灌溉水渠的占用行为情节严重，造成重大损失或影响，且行为人具有破坏生产经营的主观故意，那么该行为可能触犯刑法中的破坏生产经营罪等罪名，将面临刑事处罚。
民事责任：
- 灌溉水渠的占用行为还可能对周边农户或集体造成经济损失。受损方有权要求侵权人承担民事赔偿责任，包括修复水渠、赔偿因水渠被占用导致的农作物减产等损失。
三、特殊情况与建议
- 特殊情况：如果灌溉水渠的建设或占用行为是经过相关部门批准，且符合土地利用规划和水利设施建设规划的，那么该行为可能是合法的。但即便如此，也应确保在占用过程中尽量减少对农民宅基地的影响，并给予合理的补偿。
- 建议：对于农民而言，如果发现灌溉水渠占用其宅基地的情况，应及时向当地水行政主管部门或相关部门反映情况，并寻求法律援助。同时，也应了解自己的权益和义务，避免在未经批准的情况下擅自占用或破坏水利设施。
综上所述，灌溉水渠如果占用农民宅基地，这一行为通常是违法的，并可能面临行政责任、刑事责任和民事责任等多重法律后果。因此，建议各方在涉及水利设施建设和占用问题时，应严格遵守相关法律法规和政策规定，确保水利设施的正常运行和农业生产的顺利进行。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。