在劳务公司雇佣的农民工发生工伤的情况下，工伤认定一般应由劳务公司负责，但具体责任划分还需根据实际情况和法律规定来确定。以下从不同角度进行分析：

1. 劳务关系与工伤认定的基本原则

   • 根据《工伤保险条例》及相关规定，工伤认定通常基于劳动者与用人单位之间存在的劳动关系。在劳务关系中，劳务公司作为用人单位，与农民工之间建立了直接的劳动关系（或事实劳动关系），因此，在农民工发生工伤时，劳务公司应承担相应的工伤认定责任。

2. 总包公司与劳务公司的责任划分

   • 总包公司作为工程项目的总承包方，通常与劳务公司签订劳务分包合同，将部分劳务工作分包给劳务公司完成。在这种情况下，总包公司并不直接与农民工建立劳动关系，而是与劳务公司之间存在合同关系。
   • 如果农民工在从事劳务工作时发生工伤，且该劳务工作属于劳务公司的分包范围，那么工伤认定应由劳务公司负责。总包公司在此情况下，除非存在过错（如未提供安全的工作环境、未履行监督职责等），否则一般不直接承担工伤认定责任。

3. 特殊情况下的责任承担

   • 如果总包公司直接雇佣了农民工，或者通过不正当手段（如以承揽、外包等名义，但实际按劳务派遣用工形式使用劳动者）规避了与农民工建立劳动关系的责任，那么在这种情况下，总包公司可能需要承担工伤认定责任。
   • 另外，如果劳务公司不具备相应的资质或未依法为农民工缴纳工伤保险费，导致农民工无法享受工伤保险待遇，那么总包公司可能因选任不当或监督不力而承担相应的补充责任。

4. 实际操作中的建议

   • 对于劳务公司而言，应依法与农民工签订劳动合同，并为其缴纳工伤保险费，以确保在发生工伤时能够顺利进行工伤认定和赔偿。
   • 对于总包公司而言，应严格审查劳务公司的资质和信誉，确保其具备承担劳务分包工作的能力和条件。同时，总包公司还应加强对劳务公司的监督和管理，确保其依法用工和履行安全责任。

总结来说，在劳务公司雇佣的农民工发生工伤的情况下，工伤认定一般应由劳务公司负责。但具体责任划分还需根据实际情况和法律规定来确定，包括劳务关系与工伤认定的基本原则、总包公司与劳务公司的责任划分、特殊情况下的责任承担以及实际操作中的建议等方面。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。