征收补偿利益分割案件确实适用诉讼时效，但具体适用情况需根据纠纷性质来判断。以下是对该问题的详细分析：
一、民事纠纷情形下的诉讼时效
在征收补偿利益分割案件中，如果纠纷主要围绕补偿款的分配、支付等民事权利义务关系展开，那么该案件通常属于民事纠纷范畴，受诉讼时效的限制。
一般诉讼时效：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。
- 起算点：自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。在征收补偿协议纠纷中，通常是从协议约定的支付补偿款期限届满之日起开始计算。
特殊情况：
- 如果征收补偿协议里对支付时间没有明确约定，诉讼时效可以从债权人要求债务人履行义务的宽限期届满之日起算。
- 诉讼时效存在中止、中断的情形。在最后六个月内，因不可抗力等法定障碍不能行使请求权的，诉讼时效中止；权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务等情形会导致诉讼时效中断，并重新计算。
二、行政纠纷情形下的诉讼时效
如果征收补偿利益分割案件涉及行政机关的行政行为，如征收决定、补偿决定等，那么该案件可能属于行政纠纷范畴，此时应适用行政诉讼的相关规定。
一般诉讼时效：
- 公民、法人或者其他组织直接向人民法院提起诉讼的，应当自知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。
特殊诉讼时效：
- 因不动产提起诉讼的案件（如征收补偿纠纷涉及不动产权益），自行政行为作出之日起超过二十年提起诉讼的，人民法院不予受理。
- 其他案件自行政行为作出之日起超过五年提起诉讼的，同样不予受理。
起算点：
- 通常是当事人知道或者应当知道行政机关作出征收补偿相关行政行为之日。例如，政府作出了征收补偿决定并送达给当事人，从当事人收到该决定之日起开始计算诉讼时效。
三、持续不作为的特殊情况
如果行政机关在征收后没有给予补偿，且这种不作为的行为一直持续，那么实际上并不存在超过诉讼时效的问题。因为只要行政机关没有履行补偿职责，权利人就可以随时向法院提起诉讼来维权。
法律建议
在处理征收补偿利益分割案件时，建议您：
- 及时咨询：由于诉讼时效问题复杂且涉及多个法律领域，建议您在遇到此类纠纷时及时向我咨询，以便更准确地了解自己的权益和诉讼时效的相关规定。
- 收集证据：无论纠纷性质如何，收集并保存好相关证据都是至关重要的。这包括征收补偿协议、政府文件、沟通记录等，以便在诉讼中证明自己的主张。
- 注意时效：密切关注诉讼时效的起算点和截止日期，确保在有效期内提起诉讼或采取其他法律措施。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。