土地转让协议中亩数和平方米不一致，并不直接决定协议的有效性，但可能引发争议。下面我将从几个角度为您详细解析这个问题：

1. 协议有效性的判断：

   • 土地转让协议的有效性主要取决于协议内容是否违反法律法规的强制性规定，以及双方当事人的真实意思表示是否一致。亩数和平方米的不一致，并不直接构成协议无效的理由。

2. 可能引发的问题：

   • 面积差异：亩数和平方米是两种不同的面积计量单位，它们之间的换算需要准确进行。如果协议中的两个数字不一致，可能是因为换算错误或笔误。这可能导致实际交付的土地面积与协议约定的面积不符，从而引发双方争议。
   • 履行困难：在协议履行过程中，如果因为面积不一致导致双方对履行标准产生分歧，可能会影响协议的顺利履行，甚至导致违约或解除协议。

3. 建议处理方式：

   • 核实面积：首先，双方应共同核实土地的实际面积，确保协议中的亩数和平方米数字准确无误。
   • 明确约定：在协议中明确约定土地的具体面积，并统一使用一种计量单位（如平方米），以避免因单位换算而产生的误解。
   • 补充协议：如果协议已经签订，但发现面积不一致，双方可以协商签订补充协议，对面积进行修正和明确。

4. 法律风险提示：

   • 在处理土地转让协议时，务必谨慎对待面积问题，确保协议的准确性和可执行性。
   • 如果因面积不一致引发争议，建议及时咨询专业律师，通过法律途径解决纠纷。

综上所述，土地转让协议中亩数和平方米不一致并不直接决定协议的有效性，但可能给协议的履行带来风险和争议。因此，建议双方在签订协议前务必核实面积，并在协议中明确约定，以确保协议的顺利履行。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。