针对您提出的“虚开专用发票已经抵扣500万判几年牢”的问题，以下是我根据相关法律条文和司法实践，为您提供的详细解答：

一、法律定性

虚开增值税专用发票，并已经用于抵扣税款，且数额达到500万元，这一行为已经构成了严重的犯罪。根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条的规定，这种行为属于“虚开的税款数额巨大”。

二、量刑标准

对于虚开增值税专用发票，且税款数额巨大的情况，法律有明确的量刑标准。具体来说：

• 自然人犯罪：将面临十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金或者没收财产的严厉刑事处罚。
• 单位犯罪：除对单位判处罚金外，还将对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法进行严厉处罚，量刑标准与自然人犯罪相同。

三、量刑影响因素

虽然法律有明确的量刑标准，但法院在量刑时，还会综合考虑多种因素，包括但不限于：

• 是否存在自首、立功、坦白等从轻、减轻情节；
• 是否积极补缴税款、挽回国家损失；
• 虚开行为是否给国家利益造成特别重大损失等其他特别严重情节。

这些因素都可能对最终的量刑产生重要影响。例如，如果犯罪嫌疑人能够积极补缴税款，或者存在自首、立功等情节，法院可能会在量刑时予以考虑，从轻或减轻处罚。

四、建议与防范措施

1. 立即咨询专业律师：如果您或您的企业涉及此类问题，应尽快寻求专业法律帮助，了解具体情况和可能的法律后果。
2. 积极配合调查：如实陈述事实，争取从轻或减轻处罚的机会。
3. 严格遵守税法规定：在今后的经营活动中，务必遵守税法规定，建立健全财务管理制度，避免类似违法行为的发生。
4. 加强内部监管：企业应加强对财务人员的培训和管理，确保税务处理的合规性，防范虚开发票等违法行为的发生。

综上所述，虚开增值税专用发票并已经抵扣500万元，属于严重的犯罪行为，将面临严厉的刑事处罚。因此，我建议您或您的企业务必严格遵守税法规定，避免此类违法行为的发生。如果已经涉及此类问题，应尽快寻求专业法律帮助，并积极配合调查，以争取从轻或减轻处罚的机会。