在立案调查期间发现当事人又有新违法行为，一般情况下是可以并案处理的，但具体还需根据案件性质、新违法行为与原案件的关联性等因素综合判断。以下从不同角度进行详细分析：

一、并案处理的法律依据与原则

并案处理在司法实践中主要依据的是案件之间的关联性以及诉讼效率的原则。当新发现的违法行为与原立案调查的案件存在直接关联，如基于同一事实、同一法律关系或同一犯罪目的等，那么将两案合并处理有助于全面查明事实，提高诉讼效率，避免重复劳动和资源浪费。

二、并案处理的具体情形

1. 同一当事人、同一法律关系：

   • 如果新违法行为与原案件涉及同一当事人，且新违法行为与原案件的法律关系紧密相连，如原案件是合同纠纷，新违法行为是合同履行过程中的欺诈行为，那么两案可以合并处理。

2. 同一犯罪事实或连续犯罪：

   • 在刑事案件中，如果新发现的违法行为与原立案调查的犯罪事实属于同一犯罪行为的不同阶段或连续犯罪行为，如原案件是盗窃未遂，新违法行为是盗窃既遂，且两行为具有连续性，那么两案可以并案处理。

3. 便于查明事实、提高效率：

   • 即使新违法行为与原案件在法律关系上不完全一致，但如果合并处理有助于全面查明事实、提高诉讼效率，且不会损害当事人的合法权益，那么也可以考虑并案处理。

三、并案处理的限制与例外

1. 案件性质差异过大：

   • 如果新违法行为与原案件在性质上差异过大，如原案件是民事纠纷，新违法行为是刑事犯罪，那么两案一般不宜合并处理，因为它们的法律程序、证据标准等存在显著差异。

2. 管辖权问题：

   • 如果新违法行为与原案件不属于同一司法机关的管辖范围，那么两案也无法合并处理。此时，需要分别由有管辖权的司法机关进行调查和处理。

3. 当事人权益保护：

   • 在考虑并案处理时，还需要充分保护当事人的合法权益。如果合并处理可能对当事人造成不公平或损害其合法权益，那么应避免并案处理。

四、实际操作中的建议

1. 全面评估案件情况：

   • 在决定是否并案处理时，应全面评估新违法行为与原案件的关联性、案件性质、管辖权以及当事人权益保护等因素。

2. 遵循法定程序：

   • 如果决定并案处理，应遵循法定程序，如制作并案决定书、通知当事人等，确保程序的合法性和正当性。

3. 注重证据收集与审查：

   • 在并案处理过程中，应注重证据的收集和审查工作，确保两案的证据能够相互印证、形成完整的证据链。

如有具体案件或法律问题，可以直接向我咨询，我会根据案件的具体情况，为你提供更详细的法律建议。