在交通法规中，并无“汽车整体未通过红灯”的明确概念，但根据车辆的具体行为和结果，可以判断其是否构成闯红灯或越线停车，并据此进行处罚。以下是对不同情况的详细分析：

1. 车辆前轮刚越过停止线就停下：

   • 法律后果：这种情况一般不算闯红灯，因为未形成完整的闯红灯证据链（即车辆驶过停止线、到达路中间、以及到达对面路口的三张照片）。但可能会被认定为“越线停车”。
   • 处罚依据：根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第五十一条规定，机动车遇停止信号时应停在停止线以外，否则可能面临20元以上200元以下的罚款，驾驶证记2分（具体处罚标准可能因地区而异）。

2. 车辆大部分已越过停止线，但及时停下未通过路口：

   • 法律后果：严格意义上，这种情况也不一定会被认定为闯红灯，需当地执法部门根据具体情况和证据判断。若未被认定闯红灯，同样可能因越线停车受到相应处罚。
   • 处罚可能性：与前轮刚越过停止线就停下的情况类似，可能面临罚款和记分的处罚，但具体标准需根据当地法规和执法部门的判断。

3. 车辆已经完全通过路口：

   • 法律后果：若红灯亮起后，车辆继续行驶并完全通过了路口，则明确被认定为闯红灯。
   • 处罚依据：依据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条及《道路交通安全违法行为记分管理办法》，将处以警告或20元以上200元以下罚款，同时驾驶证一次记6分。

特殊情况下的申诉与撤销处罚：

• 在某些特殊情况下，如被大型车辆遮挡视线、交警指挥与信号灯不一致、救助危难等，驾驶员有可能通过行政复议撤销处罚。但需提供相关证据，如行车记录仪视频、现场照片、医院证明等，以证明当时的实际情况。

建议与提醒：

• 驾驶者在行驶过程中应严格遵守交通规则，注意观察交通信号灯，确保安全驾驶。当红灯亮起时，无论车辆处于何种位置，都应立即停车等待绿灯再行通过。
• 对于交通法规的任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。

综上所述，汽车整体未通过红灯的处罚取决于车辆的具体行为和结果。驾驶者应时刻保持警惕，遵守交通规则，确保行车安全。如有任何疑问或需要法律帮助，请随时向我提问。