协议履行还款后，法院一般会根据还款的具体情况作出结案或继续执行的相应处理。具体来说，可以从以下几个角度进行分析：

1. 完全履行还款义务：

   • 如果债务人已经按照协议完全履行了还款义务，那么债权人应当向法院提交结案申请。
   • 法院在核实还款情况后，会作出结案裁定，终结该案件的执行程序。这意味着债务人已经履行了其法律义务，案件到此为止，不再继续执行。

2. 部分履行还款义务：

   • 如果债务人只履行了部分还款义务，那么债权人可以与债务人协商，看是否能够达成新的还款协议。
   • 如果协商不成，债权人可以向法院申请恢复执行，要求债务人继续履行剩余的还款义务。法院在审查后，会决定是否恢复执行，并采取相应的执行措施。

3. 未履行还款义务但达成和解：

   • 在执行过程中，如果债务人和债权人达成了和解协议，并且债务人按照和解协议履行了还款义务，那么法院也会根据和解协议的履行情况作出相应的处理。
   • 如果和解协议已经履行完毕，法院会作出结案裁定；如果和解协议部分履行，债权人可以申请恢复执行剩余部分。

4. 特殊情况下的处理：

   • 如果债务人因特殊原因（如经济困难、重大疾病等）无法按时履行还款义务，但愿意分期履行或提供其他担保方式，债权人可以考虑与债务人协商，并向法院申请变更执行方式或中止执行。
   • 法院在审查后，会根据实际情况作出相应的裁定，以保障债权人的合法权益，同时也兼顾债务人的实际情况。

在协议履行还款后，无论哪种情况，都建议债务人保留好还款凭证和相关证据，以便在需要时向法院证明自己的履行情况。同时，如果债权人对还款情况有异议或认为债务人未完全履行还款义务，也可以向法院提出异议或申请恢复执行。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。