针对您提出的“旅馆的特种行业许可证不合格怎么处罚”的问题，以下是我根据相关法律法规为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，旅馆业属于特种行业，其经营必须依法取得特种行业许可证。若旅馆的特种行业许可证不合格，即存在未取得许可证擅自经营、许可证过期未续、许可证被吊销后仍继续经营等情形，将面临相应的法律处罚。

一、处罚依据

主要依据《安徽省特种行业治安管理条例》等相关法律法规。该条例明确规定了特种行业经营者的法律责任，包括未取得许可证擅自经营、存在治安隐患未整改、违反登记和信息报送规定等情形的处罚措施。

二、具体处罚措施

1. 未取得许可证擅自经营：

   • 对于企业、事业单位，由公安机关依法予以取缔，并处一万元以上五万元以下罚款。
   • 对于个人，由公安机关依法予以取缔，处十日以上十五日以下拘留，并处五百元以上一千元以下罚款；情节较轻的，处五日以下拘留或者两百元以上五百元以下罚款。

2. 存在治安隐患未整改：

   • 若旅馆存在治安隐患，如未按照规定采集、上传或报送人员与物品信息、未安装或使用视频监控设备等，公安机关将责令限期整改，并处警告。
   • 逾期不整改，造成公民人身伤害、公私财产损失，或严重威胁公民人身安全、公私财产安全或公共安全的，对单位处一万元以上五万元以下罚款，对单位主要负责人和其他直接责任人员处五百元以上五千元以下罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

3. 违反登记和信息报送规定：

   • 旅馆业经营者若对零时以后滞留旅客房间的访客未按规定登记身份信息，或违反其他登记和信息报送规定，由公安机关责令改正；情节严重的，处两百元以上五百元以下罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

三、处罚程序

公安机关在发现旅馆特种行业许可证不合格或存在其他违法行为时，将依法进行立案、调查、审查、告知、决定、送达和执行等程序。在作出处罚决定前，会制作《行政处罚告知书》送达当事人，告知其违法事实及享有的陈述、申辩等权利。符合听证规定的，还会制定《行政处罚听证告知书》。

四、建议与提醒

为了避免因特种行业许可证不合格而面临法律处罚，旅馆经营者应严格遵守相关法律法规，确保依法取得并保持许可证的有效性。同时，应加强内部管理，完善各项安全制度和措施，确保旅馆的治安安全。

综上所述，旅馆的特种行业许可证不合格将面临严厉的法律处罚。因此，旅馆经营者应高度重视许可证的合法性和有效性，确保合规经营。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请及时咨询当地公安机关或相关法律专业人士。